Генерировать одинаковые случайные числа в R и Julia
Я хотел бы генерировать одинаковые случайные числа в R и Julia. По умолчанию оба языка используют библиотеку Mersenne-Twister, однако в Julia 1.0.0:
julia> using Random
julia> Random.seed!(3)
julia> rand()
0.8116984049958615
производит 0.811...
, в то время как в R:
set.seed(3)
runif(1)
производит 0.168
.
какие идеи?
связанные так вопросы здесь и здесь.
мой случай использования для тех, кто заинтересован: тестирование нового кода Julia, который требуется генерация случайных чисел( например, статистическая загрузка) путем сравнения выходных данных с данными эквивалентных библиотек в R.
3 ответов
Это старая проблема.
Пол Гилберт обратился к тому же вопросу в конце 1990-х годов (!!) при попытке утверждать, что моделирование в R (тогда новичок) дало тот же результат, что и в S-Plus (тогда действующий).
его решение, и еще золотой подход AFAICT: повторно реализовать в свежем коде на обоих языках как это единственный способ обеспечить одинаковый посев, состояние,... и все, что на него влияет.
достижения RCall
предложение, сделанное @Khashaa, ясно, что вы можете установить семя и получить случайные числа из R
.
julia> using RCall
julia> RCall.reval("set.seed(3)")
RCall.NilSxp(16777344,Ptr{Void} @0x0a4b6330)
julia> a = zeros(Float64,20);
julia> unsafe_copy!(pointer(a), RCall.reval("runif(20)").pv, 20)
Ptr{Float64} @0x972f4860
julia> map(x -> @printf("%20.15f\n", x), a);
0.168041526339948
0.807516399072483
0.384942351374775
0.327734317164868
0.602100674761459
0.604394054040313
0.124633444240317
0.294600924244151
0.577609919011593
0.630979274399579
0.512015897547826
0.505023914156482
0.534035353455693
0.557249435689300
0.867919487645850
0.829708693316206
0.111449153395370
0.703688358888030
0.897488264366984
0.279732553754002
и R
:
> options(digits=15)
> set.seed(3)
> runif(20)
[1] 0.168041526339948 0.807516399072483 0.384942351374775 0.327734317164868
[5] 0.602100674761459 0.604394054040313 0.124633444240317 0.294600924244151
[9] 0.577609919011593 0.630979274399579 0.512015897547826 0.505023914156482
[13] 0.534035353455693 0.557249435689300 0.867919487645850 0.829708693316206
[17] 0.111449153395370 0.703688358888030 0.897488264366984 0.279732553754002
**редактировать**
по предложению @ColinTBowers, вот более простой / чистый способ доступа R
случайные числа из Julia
.
julia> using RCall
julia> reval("set.seed(3)");
julia> a = rcopy("runif(20)");
julia> map(x -> @printf("%20.15f\n", x), a);
0.168041526339948
0.807516399072483
0.384942351374775
0.327734317164868
0.602100674761459
0.604394054040313
0.124633444240317
0.294600924244151
0.577609919011593
0.630979274399579
0.512015897547826
0.505023914156482
0.534035353455693
0.557249435689300
0.867919487645850
0.829708693316206
0.111449153395370
0.703688358888030
0.897488264366984
0.279732553754002
посмотреть:
?set.seed
"Мерсенн-Твистер": От Мацумото и Нисимуры (1998). Скрученный GFSR с периодом 2^19937-1 и равнораспределением в 623 последовательных измерениях (за весь период). "Семя" -это 624-мерный набор 32-разрядных целых чисел плюс текущая позиция в этом наборе.
и вы можете увидеть, можете ли вы связать один и тот же код C с обоих языков. Если вы хотите увидеть список/вектор, типа:
.Random.seed