Как график оценки сетки от GridSearchCV?
Я ищу способ построить график grid_scores_ из GridSearchCV в sklearn. В этом примере я пытаюсь найти в сетке лучшие параметры gamma и C для алгоритма SVR. Мой код выглядит следующим образом:
C_range = 10.0 ** np.arange(-4, 4)
gamma_range = 10.0 ** np.arange(-4, 4)
param_grid = dict(gamma=gamma_range.tolist(), C=C_range.tolist())
grid = GridSearchCV(SVR(kernel='rbf', gamma=0.1),param_grid, cv=5)
grid.fit(X_train,y_train)
print(grid.grid_scores_)
после запуска кода и печати оценок сетки я получаю следующий результат:
[mean: -3.28593, std: 1.69134, params: {'gamma': 0.0001, 'C': 0.0001}, mean: -3.29370, std: 1.69346, params: {'gamma': 0.001, 'C': 0.0001}, mean: -3.28933, std: 1.69104, params: {'gamma': 0.01, 'C': 0.0001}, mean: -3.28925, std: 1.69106, params: {'gamma': 0.1, 'C': 0.0001}, mean: -3.28925, std: 1.69106, params: {'gamma': 1.0, 'C': 0.0001}, mean: -3.28925, std: 1.69106, params: {'gamma': 10.0, 'C': 0.0001},etc]
Я хотел бы визуализировать все оценки (средние значения) в зависимости от параметров гаммы и C. График я пытаюсь получить должен выглядеть как следует:
где ось x-гамма, ось y-средний балл (в данном случае среднеквадратичная ошибка), а разные линии представляют разные значения C.
4 ответов
from sklearn.svm import SVC
from sklearn.grid_search import GridSearchCV
from sklearn import datasets
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
import numpy as np
digits = datasets.load_digits()
X = digits.data
y = digits.target
clf_ = SVC(kernel='rbf')
Cs = [1, 10, 100, 1000]
Gammas = [1e-3, 1e-4]
clf = GridSearchCV(clf_,
dict(C=Cs,
gamma=Gammas),
cv=2,
pre_dispatch='1*n_jobs',
n_jobs=1)
clf.fit(X, y)
scores = [x[1] for x in clf.grid_scores_]
scores = np.array(scores).reshape(len(Cs), len(Gammas))
for ind, i in enumerate(Cs):
plt.plot(Gammas, scores[ind], label='C: ' + str(i))
plt.legend()
plt.xlabel('Gamma')
plt.ylabel('Mean score')
plt.show()
- код основан на этой.
- только загадочная часть: будет ли sklearn всегда уважать порядок C & Gamma - > официальный пример использует этот "заказ"
выход:
код, показанный @sascha, правильный. Однако .
Он может быть реализован аналогично методу @sascha:
def plot_grid_search(cv_results, grid_param_1, grid_param_2, name_param_1, name_param_2):
# Get Test Scores Mean and std for each grid search
scores_mean = cv_results['mean_test_score']
scores_mean = np.array(scores_mean).reshape(len(grid_param_2),len(grid_param_1))
scores_sd = cv_results['std_test_score']
scores_sd = np.array(scores_sd).reshape(len(grid_param_2),len(grid_param_1))
# Plot Grid search scores
_, ax = plt.subplots(1,1)
# Param1 is the X-axis, Param 2 is represented as a different curve (color line)
for idx, val in enumerate(grid_param_2):
ax.plot(grid_param_1, scores_mean[idx,:], '-o', label= name_param_2 + ': ' + str(val))
ax.set_title("Grid Search Scores", fontsize=20, fontweight='bold')
ax.set_xlabel(name_param_1, fontsize=16)
ax.set_ylabel('CV Average Score', fontsize=16)
ax.legend(loc="best", fontsize=15)
ax.grid('on')
# Calling Method
plot_grid_search(pipe_grid.cv_results_, n_estimators, max_features, 'N Estimators', 'Max Features')
вышеуказанные результаты в следующем графике:
порядок обхода сетки параметров является детерминированным, так что его можно изменить и построить прямолинейно. Что-то вроде этого:--2-->
scores = [entry.mean_validation_score for entry in grid.grid_scores_]
# the shape is according to the alphabetical order of the parameters in the grid
scores = np.array(scores).reshape(len(C_range), len(gamma_range))
for c_scores in scores:
plt.plot(gamma_range, c_scores, '-')
Я хотел сделать что-то подобное (но масштабируемое до большого количества параметров), и вот мое решение для генерации графиков Роя вывода:
score = pd.DataFrame(gs_clf.grid_scores_).sort_values(by='mean_validation_score', ascending = False)
for i in parameters.keys():
print(i, len(parameters[i]), parameters[i])
score[i] = score.parameters.apply(lambda x: x[i])
l =['mean_validation_score'] + list(parameters.keys())
for i in list(parameters.keys()):
sns.swarmplot(data = score[l], x = i, y = 'mean_validation_score')
#plt.savefig('170705_sgd_optimisation//'+i+'.jpg', dpi = 100)
plt.show()