как именно работает подмодуль git

ваш подмодуль представлен как специальная запись со специальным режимом (называется gitlink в разделе "вложенные репозитории git без подмодулей?"):
(См.--15-->проверка мимо подмодуля git commit")

new file mode 160000
index 0000000..4c4c5a2

поэтому он не проверяет "последнюю" версию, но всегда определенный SHA1, и он делает это в отдельно стоящее HEAD режим (см. "как сделать подмодуль с отсоединенным HEAD to прикрепитесь к фактическому HEAD?".

это не означает, что вы не можете обновить подмодуль, как я объясняю в "истинная природа подмодулей".

подробнее о подмодулях и о том, почему вы могли бы не хочу использовать их(!), читайте отрезвляющую статью"почему ваша компания не должна использовать подмодули Git", from Янтарь Юст (кроме так).

как раз одна небольшая выдержка, для Пинки и хихиканье (акцент мой):

при вызове git submodule update он ищет в Родительском репозитории SHA для каждого подмодуля, входит в эти подмодули и проверяет соответствующие SHAs.
Как и в случае, если вы проверили SHA в обычном репозитории, это помещает подмодуль в отдельное головное состояние.

если вы затем внесете изменения в подмодуль и зафиксируете тогда, Git с радостью создаст фиксацию... и оставит вас все еще с отделенная голова. Видишь, к чему все идет?

скажем, вы объединяете еще несколько изменений, которые включают в себя другое обновление подмодуля. Если вы еще не совершили собственное изменение подмодуля в родительский проект, Git не будет рассматривать вашу новую фиксацию в подмодуле как конфликт, и если вы запустите git submodule update он с радостью уничтожит вашу фиксацию без предупреждения, заменив ее на ветку, которую вы только что объединили в.

Я надеюсь, что у вас был ваш субмодуль х reflog включено или все еще имеет старую фиксацию в прокрутке терминала,потому что в противном случае, вы просто потеряли все, что вы сделали.

Err... "ой."

обратите внимание, что теперь подмодуль может отслеживать последние из ветки: см."git подмодуль отслеживания последние".