Как правильно обернуть std:: vector с SWIG для Python? Проблемы с std:: размер t
я пытаюсь сделать std::vector<std::size_t> для работы с SWIG. Мне нужно предоставить интерфейс python для библиотеки c++. std::vectors примитивных типов и объектов работают нормально, но есть проблема с std::size_t.
я предоставляю MCVE на github здесь.
главная проблема
в основном проблема в том, что std::size_t не признала и std::vector<std::size_t> трактуется как std::vector< int,std::allocator< int > > *. Когда я пытаюсь указать шаблон, я получаю следующий.
используя %template(VecSize) std::vector<std::size_t>; выдает:
swig -c++ -python c_swig_vec_std_size.i
:0: Warning(490): Fragment 'SWIG_AsVal_std_size_t' not found.
:0: Warning(490): Fragment 'SWIG_From_std_size_t' not found.
g++ -fpic -c c_swig_vec_std_size_wrap.cxx -I/public/users/paul/dev/software/Python-2.7.11/Include -I/public/users/paul/dev/software/Python-2.7.11
c_swig_vec_std_size_wrap.cxx: In static member function ‘static int swig::traits_asval<long unsigned int>::asval(PyObject*, swig::traits_asval::value_type*)’:
c_swig_vec_std_size_wrap.cxx:4289: error: ‘SWIG_AsVal_std_size_t’ was not declared in this scope
c_swig_vec_std_size_wrap.cxx: In static member function ‘static PyObject* swig::traits_from<long unsigned int>::from(const swig::traits_from::value_type&)’:
c_swig_vec_std_size_wrap.cxx:4295: error: ‘SWIG_From_std_size_t’ was not declared in this scope
make: *** [c] Error 1
Минимальный Пример
пример C++ класс
следующий класс достаточно, чтобы показать функциональность, которая мне нужна. The std::vector<int> включается, чтобы показать предполагаемое поведение.
class_vec_std_size.ГЭС
#ifndef STD_SIZE_VEC
#define STD_SIZE_VEC
#include <vector>
class StdSizeVec{
public:
StdSizeVec(){
_myVec = std::vector<std::size_t>();
_myVec.push_back(1);
_myVec.push_back(2);
_myInts = std::vector<int>();
_myInts.push_back(1);
_myInts.push_back(2);
}
~StdSizeVec(){
_myVec.clear();
}
inline std::vector<std::size_t> getValues(){
return _myVec;
}
inline std::vector<int> getInts(){
return _myInts;
}
private:
std::vector<std::size_t> _myVec;
std::vector<int> _myInts;
};
#endif
различные попытки интерфейса
a_swig_vec_std_size.я!--48-->
%module a_swig_vec_std_size
%{
#include "class_vec_std_size.hpp"
%}
%include "class_vec_std_size.hpp"
%module a_swig_vec_std_size
%{
#include "class_vec_std_size.hpp"
%}
%include "class_vec_std_size.hpp"
выход
[paul@login-0-0 stack_swig]$ python
Python 2.7.11 (default, May 7 2016, 23:37:19)
[GCC 4.4.7 20120313 (Red Hat 4.4.7-16)] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> from a_swig_vec_std_size import StdSizeVec
>>> ssv = StdSizeVec()
>>> vals = ssv.getValues()
>>> vals
<Swig Object of type 'std::vector< std::size_t > *' at 0x2ad7047be330>
>>> ints = ssv.getInts()
>>> ints
<Swig Object of type 'std::vector< int > *' at 0x2ad7047be780>
>>> exit()
swig/python detected a memory leak of type 'std::vector< int > *', no destructor found.
swig/python detected a memory leak of type 'std::vector< std::size_t > *', no destructor found.
[paul@login-0-0 stack_swig]$
это основной наивный подход. Указатели не полезны в python, и есть сообщения об утечке памяти, которые мы не можем предоставить пользователям интерфейса.
b_swig_vec_std_size.я!--48-->
%module b_swig_vec_std_size
%{
#include "class_vec_std_size.hpp"
%}
%include "std_vector.i"
%include "class_vec_std_size.hpp"
%module b_swig_vec_std_size
%{
#include "class_vec_std_size.hpp"
%}
%include "std_vector.i"
%include "class_vec_std_size.hpp"
выход
[paul@login-0-0 stack_swig]$ python
Python 2.7.11 (default, May 7 2016, 23:37:19)
[GCC 4.4.7 20120313 (Red Hat 4.4.7-16)] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> from b_swig_vec_std_size import StdSizeVec
>>> ssv = StdSizeVec()
>>> vals = ssv.getValues()
>>> vals
<Swig Object of type 'std::vector< std::size_t,std::allocator< std::size_t > > *' at 0x2aee17458330>
>>> ints = ssv.getInts()
>>> ints
<Swig Object of type 'std::vector< int,std::allocator< int > > *' at 0x2aee17458930>
>>> exit()
swig/python detected a memory leak of type 'std::vector< int,std::allocator< int > > *', no destructor found.
swig/python detected a memory leak of type 'std::vector< std::size_t,std::allocator< std::size_t > > *', no destructor found.
используя правильный "std_vector.i", SWIG знает больше о векторе и распределителях, но все же эти указатели не полезны для клиентского кода в python, и есть ошибка утечки памяти сообщения.
c_swig_vec_std_size.я!--48-->
этот интерфейс использует правильно %template директивы, как ответ. Здесь SWIG не понимает std::size_t в качестве аргумента шаблона.
%module c_swig_vec_std_size
%{
#include "class_vec_std_size.hpp"
%}
%include "std_vector.i"
%template(VecInt) std::vector<int>;
// Does not compile
//%template(VecSize) std::vector<std::size_t>;
//
// Gives the following errors
//swig -c++ -python c_swig_vec_std_size.i
// :0: Warning(490): Fragment 'SWIG_AsVal_std_size_t' not found.
// :0: Warning(490): Fragment 'SWIG_From_std_size_t' not found.
// g++ -fpic -c c_swig_vec_std_size_wrap.cxx -I/public/users/paul/dev/software/Python-2.7.11/Include -I/public/users/paul/dev/software/Python-2.7.11
// c_swig_vec_std_size_wrap.cxx: In static member function ‘static int swig::traits_asval<long unsigned int>::asval(PyObject*, swig::traits_asval::value_type*)’:
// c_swig_vec_std_size_wrap.cxx:4289: error: ‘SWIG_AsVal_std_size_t’ was not declared in this scope
// c_swig_vec_std_size_wrap.cxx: In static member function ‘static PyObject* swig::traits_from<long unsigned int>::from(const swig::traits_from::value_type&)’:
// c_swig_vec_std_size_wrap.cxx:4295: error: ‘SWIG_From_std_size_t’ was not declared in this scope
// make: *** [c] Error 1
//The following compiles but does not work
%template(VecSize) std::vector<size_t>;
%include "class_vec_std_size.hpp"
выход
[paul@login-0-0 stack_swig]$ python
Python 2.7.11 (default, May 7 2016, 23:37:19)
[GCC 4.4.7 20120313 (Red Hat 4.4.7-16)] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> from c_swig_vec_std_size import StdSizeVec
>>> ssv = StdSizeVec()
>>> vals = ssv.getValues()
>>> vals
<Swig Object of type 'std::vector< std::size_t,std::allocator< std::size_t > > *' at 0x2b286104bd80>
>>> ints = ssv.getInts()
>>> ints
(1, 2)
>>> exit()
swig/python detected a memory leak of type 'std::vector< std::size_t,std::allocator< std::size_t > > *', no destructor found.
теперь std::vector<int> работает нормально, но (без std::) не делает работу.
некоторые интернет-рытье
я нашел несколько сообщений, которые предлагают некоторые ключи.
ощущение этой нашел 2006 сообщение с той же проблемой
на std::vector:: size_type обернутый как указатель не целое число ссылка имела некоторую полезную информацию, но проблема не совсем то же самое.
после что я пытался реализовать SWIG_AsVal_std_size_t и SWIG_From_std_size_t похоже на их подход, но не повезло.
ручной прокат std_size_t.я!--48-->
%fragment("SWIG_From_std_size_t", "header", fragment=SWIG_From_frag(std::size_t))
{
SWIGINTERNINLINE PyObject * SWIG_From_std_size_t(std::size_t value)
{
return PyInt_FromSize_t(value);
}
}
%fragment("SWIG_AsVal_std_size_t", "header")
{
SWIGINTERNINLINE bool SWIG_AsVal_std_size_t(PyObject* in, std::size_t& value)
{
// Get integer type
if(PyInt_Check(in)){
long unsigned int long_uint = PyLong_AsLong(in);
value = static_cast<std::size_t>(long_uint);
return true;
}else{
return false;
}
}
}
%fragment(SWIG_From_frag(std::size_t));
%fragment("SWIG_AsVal_std_size_t");
%fragment("SWIG_From_std_size_t", "header", fragment=SWIG_From_frag(std::size_t))
{
SWIGINTERNINLINE PyObject * SWIG_From_std_size_t(std::size_t value)
{
return PyInt_FromSize_t(value);
}
}
%fragment("SWIG_AsVal_std_size_t", "header")
{
SWIGINTERNINLINE bool SWIG_AsVal_std_size_t(PyObject* in, std::size_t& value)
{
// Get integer type
if(PyInt_Check(in)){
long unsigned int long_uint = PyLong_AsLong(in);
value = static_cast<std::size_t>(long_uint);
return true;
}else{
return false;
}
}
}
%fragment(SWIG_From_frag(std::size_t));
%fragment("SWIG_AsVal_std_size_t");
это было импортировано в d_swig_vec_std_size.я!--95-->. но он не компилируется.
%module d_swig_vec_std_size
%{
#include "class_vec_std_size.hpp"
%}
%include "std_vector.i"
%template(VecInt) std::vector<int>;
%include "std_size_t.i"
%template(VecSize) std::vector<std::size_t>;
%include "class_vec_std_size.hpp"
вот, я понял.
swig -c++ -python d_swig_vec_std_size.i
g++ -fpic -c d_swig_vec_std_size_wrap.cxx -I/public/users/paul/dev/software/Python-2.7.11/Include -I/public/users/paul/dev/software/Python-2.7.11
d_swig_vec_std_size_wrap.cxx: In static member function ‘static int swig::traits_asval<long unsigned int>::asval(PyObject*, swig::traits_asval::value_type*)’:
d_swig_vec_std_size_wrap.cxx:4311: error: invalid initialization of reference of type ‘size_t&’ from expression of type ‘swig::traits_asval::value_type*’
d_swig_vec_std_size_wrap.cxx:4288: error: in passing argument 2 of ‘bool SWIG_AsVal_std_size_t(PyObject*, size_t&)’
make: *** [d] Error 1
make-файл
PYTHON=/public/users/paul/dev/software/Python-2.7.11
all: a b c d
a:
swig -c++ -python a_swig_vec_std_size.i
g++ -fpic -c a_swig_vec_std_size_wrap.cxx -I${PYTHON}/Include -I${PYTHON}
g++ -g -fpic -shared a_swig_vec_std_size_wrap.o -o _a_swig_vec_std_size.so
b:
swig -c++ -python b_swig_vec_std_size.i
g++ -fpic -c b_swig_vec_std_size_wrap.cxx -I${PYTHON}/Include -I${PYTHON}
g++ -g -fpic -shared b_swig_vec_std_size_wrap.o -o _b_swig_vec_std_size.so
c:
swig -c++ -python c_swig_vec_std_size.i
g++ -fpic -c c_swig_vec_std_size_wrap.cxx -I${PYTHON}/Include -I${PYTHON}
g++ -g -fpic -shared c_swig_vec_std_size_wrap.o -o _c_swig_vec_std_size.so
d:
swig -c++ -python d_swig_vec_std_size.i
g++ -fpic -c d_swig_vec_std_size_wrap.cxx -I${PYTHON}/Include -I${PYTHON}
g++ -g -fpic -shared d_swig_vec_std_size_wrap.o -o _d_swig_vec_std_size.so
clean: clean_a clean_b clean_c clean_d
clean_a:
rm a_swig_vec_std_size_wrap.cxx a_swig_vec_std_size.py a_swig_vec_std_size_wrap.o _a_swig_vec_std_size.so
clean_b:
rm b_swig_vec_std_size_wrap.cxx b_swig_vec_std_size.py b_swig_vec_std_size_wrap.o _b_swig_vec_std_size.so
clean_c:
rm c_swig_vec_std_size_wrap.cxx c_swig_vec_std_size.py c_swig_vec_std_size_wrap.o _c_swig_vec_std_size.so
clean_d:
rm d_swig_vec_std_size_wrap.cxx d_swig_vec_std_size.py d_swig_vec_std_size_wrap.o _d_swig_vec_std_size.so
Программы
python version: Python 2.7.11
g++ version: g++ (GCC) 4.4.7
swig version: SWIG Version 1.3.40
использование более новой версии swig (swig-3.0.10) дает тот же результат для мне.
резюме
я подозреваю, что ответ может быть по линиям интерфейса dstd::size_t реализуется по-разному в зависимости от архитектуры вместо того, чтобы иметь фиксированный размер. В любом случае, я ожидал, что SWIG сможет справиться с этим. Я что-то упускаю? Я хотел бы найти решение, которое не требует внесения изменений в библиотеку C++ (например, инкапсуляции std:: size_t в struct или через int вместо).
попытка решения Йенса Монка
namespace std {
%template(VecSize) vector<size_t>;
}
я понимаю:
[paul@login-0-0 stack_swig]$ make clean
rm a_swig_vec_std_size_wrap.cxx a_swig_vec_std_size.py a_swig_vec_std_size_wrap.o _a_swig_vec_std_size.so
rm b_swig_vec_std_size_wrap.cxx b_swig_vec_std_size.py b_swig_vec_std_size_wrap.o _b_swig_vec_std_size.so
rm c_swig_vec_std_size_wrap.cxx c_swig_vec_std_size.py c_swig_vec_std_size_wrap.o _c_swig_vec_std_size.so
rm d_swig_vec_std_size_wrap.cxx d_swig_vec_std_size.py d_swig_vec_std_size_wrap.o _d_swig_vec_std_size.so
[paul@login-0-0 stack_swig]$ make
swig -c++ -python a_swig_vec_std_size.i
g++ -fpic -c a_swig_vec_std_size_wrap.cxx -I/public/users/paul/dev/software/Python-2.7.11/Include -I/public/users/paul/dev/software/Python-2.7.11
g++ -g -fpic -shared a_swig_vec_std_size_wrap.o -o _a_swig_vec_std_size.so
swig -c++ -python b_swig_vec_std_size.i
g++ -fpic -c b_swig_vec_std_size_wrap.cxx -I/public/users/paul/dev/software/Python-2.7.11/Include -I/public/users/paul/dev/software/Python-2.7.11
g++ -g -fpic -shared b_swig_vec_std_size_wrap.o -o _b_swig_vec_std_size.so
swig -c++ -python c_swig_vec_std_size.i
g++ -fpic -c c_swig_vec_std_size_wrap.cxx -I/public/users/paul/dev/software/Python-2.7.11/Include -I/public/users/paul/dev/software/Python-2.7.11
g++ -g -fpic -shared c_swig_vec_std_size_wrap.o -o _c_swig_vec_std_size.so
swig -c++ -python -I/public/users/paul/dev/software/swig-3.0.10 d_swig_vec_std_size.i
g++ -fpic -c d_swig_vec_std_size_wrap.cxx -I/public/users/paul/dev/software/Python-2.7.11/Include -I/public/users/paul/dev/software/Python-2.7.11
g++ -g -fpic -shared d_swig_vec_std_size_wrap.o -o _d_swig_vec_std_size.so
[paul@login-0-0 stack_swig]$ python
Python 2.7.11 (default, May 7 2016, 23:37:19)
[GCC 4.4.7 20120313 (Red Hat 4.4.7-16)] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> from d_swig_vec_std_size import StdSizeVec
>>> ssv = StdSizeVec()
>>> vals = ssv.getValues()
>>> vals
<Swig Object of type 'std::vector< std::size_t,std::allocator< std::size_t > > *' at 0x2aba7dd8bd80>
>>> ints - ssv.getInts()
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
NameError: name 'ints' is not defined
>>> ints = ssv.getInts()
>>> ints
(1, 2)
>>> exit()
swig/python detected a memory leak of type 'std::vector< std::size_t,std::allocator< std::size_t > > *', no destructor found.
[paul@login-0-0 stack_swig]$ cat d_swig_vec_std_size.i
%module d_swig_vec_std_size
%{
#include "class_vec_std_size.hpp"
%}
%include "std_vector.i"
%template(VecInt) std::vector<int>;
%include "std_size_t.i"
namespace std {
%template(VecSize) vector<size_t>;
}
%include "class_vec_std_size.hpp"
2 ответов
попробуйте определить size_t для swig, как показано здесь -http://www.swig.org/Doc1.3/SWIG.html#SWIG_nn20
%inline %{
typedef long unsigned int size_t;
%}
namespace std {
%template(VecSize) vector<size_t>;
}
создайте свои шаблоны следующим образом
namespace std {
%template(VecSize) vector<size_t>;
}
он работает здесь с этим изменением из коробки. Я использую SWIG 3.0.2, g++ 4.9.2 и Python 2.7.9.
Я изменил d_swig_vec_std_size.i в вашем проекте и включить путь к /usr/include/python2.7 в вашем makefile
%module d_swig_vec_std_size
%{
#include "class_vec_std_size.hpp"
%}
%include "std_vector.i"
%template(VecInt) std::vector<int>;
%include "std_size_t.i"
namespace std {
%template(VecSize) vector<size_t>;
}
%include "class_vec_std_size.hpp"