как рисовать мультиграф в networkx с помощью matplotlib или graphviz

когда я передаю матрицу смежности multigraph numpy в networkx (используя функцию from_numpy_matrix) а затем попробуйте нарисовать график с помощью matplotlib, он игнорирует несколько ребер.

Как я могу заставить его рисовать несколько краев ?

15
networkx python-2.7

1 ответов

Graphviz хорошо рисует параллельные ребра. Вы можете использовать это с NetworkX, написав точечный файл, а затем обрабатывая Graphviz (например, Neato layout ниже). Вам понадобится pydot или pygraphviz в дополнение к NetworkX

In [1]: import networkx as nx

In [2]: G=nx.MultiGraph()

In [3]: G.add_edge(1,2)

In [4]: G.add_edge(1,2)

In [5]: nx.write_dot(G,'multi.dot')

In [6]: !neato -T png multi.dot > multi.png

enter image description here

на NetworkX 1.11 и новее, nx.write_dot не работает в выпуск на networkx github. Обходным путем является вызов write_dot используя

from networkx.drawing.nx_pydot import write_dot

или

from networkx.drawing.nx_agraph import write_dot

14