Как установить библиотеку stringi из архива и установить локальную icu52l.zip

мы неуклюже делаем некоторые R-коды в рабочей среде, и в рамках этого мы устанавливаем некоторые R-пакеты следующим образом:

# Default directories and mirrors
WORKING_DIR  <- "/srv/foo/bar/baz"

LIB_DIR      <- paste( WORKING_DIR, "libs", sep="/" )
setwd(WORKING_DIR)
stringi.loc <- paste( WORKING_DIR, "stringi_0.4-1.tar.gz", sep="/" )

Это может быть не самый элегантный способ установки пакетов R, но, похоже, он работает нормально для нас (любые другие советы по управлению пакетами R будут приветствоваться, но немного поздно на этом этапе :).

однако пакет stringi, похоже, зависит от пакета icu52l, который он устанавливает над сеть:

checking for R... /usr/lib64/R/bin/R
checking for gcc... gcc -std=gnu99
checking whether the C compiler works... yes
checking for C compiler default output file name... a.out
checking for suffix of executables... 
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether gcc -std=gnu99 accepts -g... yes
checking for gcc -std=gnu99 option to accept ISO C89... none needed
checking whether we are using the GNU C++ compiler... yes
checking whether g++ accepts -g... yes
checking for cat... /bin/cat
checking for pkg-config... /usr/bin/pkg-config
checking with pkg-config for ICU4C installed... no
*** The pkg-config script did not detect ICU4C-devel libraries installed
*** We will build ICU4C from sources
checking how to run the C++ preprocessor... g++ -E
checking for grep that handles long lines and -e... /bin/grep
checking for egrep... /bin/grep -E
checking for ANSI C header files... yes
checking for sys/types.h... yes
checking for sys/stat.h... yes
checking for stdlib.h... yes
checking for string.h... yes
checking for memory.h... yes
checking for strings.h... yes
checking for inttypes.h... yes
checking for stdint.h... yes
checking for unistd.h... yes
checking elf.h usability... yes
checking elf.h presence... yes
checking for elf.h... yes
configure: creating ./config.status
config.status: creating src/Makevars
config.status: creating src/icu52_found.txt
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. -Iicu52 -Iicu52/unicode -Iicu52/common -Iicu52/i18n -DU_STATIC_IMPLEMENTATION -DU_COMMON_IMPLEMENTATION -DU_I18N_IMPLEMENTATION -DUCONFIG_USE_LOCAL -DNDEBUG     -DU_HAVE_ELF_H -fpic  -g  -c stri_brkiter.cpp -o stri_brkiter.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. -Iicu52 -Iicu52/unicode -Iicu52/common -Iicu52/i18n -DU_STATIC_IMPLEMENTATION -DU_COMMON_IMPLEMENTATION -DU_I18N_IMPLEMENTATION -DUCONFIG_USE_LOCAL -DNDEBUG     -DU_HAVE_ELF_H -fpic  -g  -c icu52/i18n/utmscale.c -o icu52/i18n/utmscale.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. -Iicu52 -Iicu52/unicode -Iicu52/common -Iicu52/i18n -DU_STATIC_IMPLEMENTATION -DU_COMMON_IMPLEMENTATION -DU_I18N_IMPLEMENTATION -DUCONFIG_USE_LOCAL -DNDEBUG     -DU_HAVE_ELF_H -fpic  -g  -c icu52/stubdata/stubdata.c -o icu52/stubdata/stubdata.o
g++ -shared -o stringi.so stri_brkiter.o stri_collator.o stri_common.o stri_compare.o stri_container_base.o stri_container_bytesearch.o stri_container_listint.o stri_container_listraw.o stri_container_listutf8.o stri_container_regex.o stri_container_usearch.o stri_container_utf16.o stri_container_utf8.o stri_container_utf8_indexable.o stri_encoding_conversion.o stri_encoding_detection.o stri_encoding_management.o stri_escape.o stri_exception.o stri_ICU_settings.o stri_join.o stri_length.o stri_pad.o stri_prepare_arg.o stri_random.o stri_reverse.o stri_search_class_count.o stri_search_class_detect.o stri_search_class_extract.o stri_search_class_locate.o stri_search_class_replace.o stri_search_class_split.o stri_search_class_startsendswith.o stri_search_class_subset.o stri_search_class_trim.o stri_search_common.o stri_search_coll_count.o stri_search_coll_detect.o stri_search_coll_extract.o stri_search_coll_locate.o stri_search_coll_replace.o stri_search_coll_split.o stri_search_coll_startsendswith.o stri_search_coll_subset.o stri_search_boundaries_count.o stri_search_boundaries_locate.o stri_search_boundaries_split.o stri_search_fixed_count.o stri_search_fixed_detect.o stri_search_fixed_extract.o stri_search_fixed_locate.o stri_search_fixed_replace.o stri_search_fixed_split.o stri_search_fixed_subset.o stri_search_fixed_startsendswith.o stri_search_in.o stri_search_other_replace.o stri_search_other_split.o stri_search_regex_count.o stri_search_regex_detect.o stri_search_regex_extract.o stri_search_regex_locate.o stri_search_regex_match.o stri_search_regex_replace.o stri_search_regex_split.o stri_search_regex_subset.o stri_stats.o stri_stringi.o stri_sub.o stri_test.o stri_trans_casemap.o stri_trans_normalization.o stri_trans_transliterate.o stri_ucnv.o stri_uloc.o stri_utils.o stri_wrap.o icu52/common/appendable.o icu52/common/bmpset.o icu52/common/brkeng.o icu52/common/brkiter.o icu52/common/bytestream.o icu52/common/bytestrie.o icu52/common/bytestriebuilder.o icu52/common/bytestrieiterator.o icu52/common/caniter.o icu52/common/chariter.o icu52/common/charstr.o icu52/common/dictbe.o icu52/common/dictionarydata.o icu52/common/dtintrv.o icu52/common/errorcode.o icu52/common/filterednormalizer2.o icu52/common/listformatter.o icu52/common/locavailable.o icu52/common/locbased.o icu52/common/locdispnames.o icu52/common/locid.o icu52/common/loclikely.o icu52/common/locresdata.o icu52/common/locutil.o icu52/common/messagepattern.o icu52/common/normalizer2.o icu52/common/normalizer2impl.o icu52/common/normlzr.o icu52/common/parsepos.o icu52/common/patternprops.o icu52/common/propname.o icu52/common/punycode.o icu52/common/putil.o icu52/common/rbbi.o icu52/common/rbbidata.o icu52/common/rbbinode.o icu52/common/rbbirb.o icu52/common/rbbiscan.o icu52/common/rbbisetb.o icu52/common/rbbistbl.o icu52/common/rbbitblb.o icu52/common/resbund_cnv.o icu52/common/resbund.o icu52/common/ruleiter.o icu52/common/schriter.o icu52/common/serv.o icu52/common/servlk.o icu52/common/servlkf.o icu52/common/servls.o icu52/common/servnotf.o icu52/common/servrbf.o icu52/common/servslkf.o icu52/common/stringpiece.o icu52/common/stringtriebuilder.o icu52/common/ubrk.o icu52/common/ucase.o icu52/common/ucasemap_titlecase_brkiter.o icu52/common/ucasemap.o icu52/common/ucharstrie.o icu52/common/ucharstriebuilder.o icu52/common/ucharstrieiterator.o icu52/common/uchriter.o icu52/common/ucnv_bld.o icu52/common/ucnv_ext.o icu52/common/ucnv_io.o icu52/common/ucnv2022.o icu52/common/ucnvbocu.o icu52/common/ucnvsel.o icu52/common/ucol_swp.o icu52/common/udata.o icu52/common/uhash_us.o icu52/common/uidna.o icu52/common/uinit.o icu52/common/uiter.o icu52/common/uloc.o icu52/common/umutex.o icu52/common/unames.o icu52/common/unifilt.o icu52/common/unifunct.o icu52/common/uniset_closure.o icu52/common/uniset_props.o icu52/common/uniset.o icu52/common/unisetspan.o icu52/common/unistr_case_locale.o icu52/common/unistr_case.o icu52/common/unistr_cnv.o icu52/common/unistr_props.o icu52/common/unistr_titlecase_brkiter.o icu52/common/unistr.o icu52/common/unorm.o icu52/common/unormcmp.o icu52/common/uobject.o icu52/common/uprops.o icu52/common/uresbund.o icu52/common/uscript_props.o icu52/common/uset_props.o icu52/common/uset.o icu52/common/usetiter.o icu52/common/ushape.o icu52/common/usprep.o icu52/common/ustack.o icu52/common/ustr_titlecase_brkiter.o icu52/common/ustr_wcs.o icu52/common/ustrcase_locale.o icu52/common/ustrcase.o icu52/common/ustrenum.o icu52/common/ustring.o icu52/common/ustrtrns.o icu52/common/utext.o icu52/common/util_props.o icu52/common/util.o icu52/common/utrie.o icu52/common/utrie2_builder.o icu52/common/utrie2.o icu52/common/uts46.o icu52/common/uvector.o icu52/common/uvectr32.o icu52/common/uvectr64.o icu52/common/cmemory.o icu52/common/cstring.o icu52/common/cwchar.o icu52/common/icudataver.o icu52/common/icuplug.o icu52/common/locmap.o icu52/common/propsvec.o icu52/common/uarrsort.o icu52/common/ubidi_props.o icu52/common/ubidi.o icu52/common/ubidiln.o icu52/common/ubidiwrt.o icu52/common/ucat.o icu52/common/uchar.o icu52/common/ucln_cmn.o icu52/common/ucmndata.o icu52/common/ucnv_cb.o icu52/common/ucnv_cnv.o icu52/common/ucnv_ct.o icu52/common/ucnv_err.o icu52/common/ucnv_lmb.o icu52/common/ucnv_set.o icu52/common/ucnv_u16.o icu52/common/ucnv_u32.o icu52/common/ucnv_u7.o icu52/common/ucnv_u8.o icu52/common/ucnv.o icu52/common/ucnvdisp.o icu52/common/ucnvhz.o icu52/common/ucnvisci.o icu52/common/ucnvlat1.o icu52/common/ucnvmbcs.o icu52/common/ucnvscsu.o icu52/common/udatamem.o icu52/common/udataswp.o icu52/common/uenum.o icu52/common/uhash.o icu52/common/uinvchar.o icu52/common/ulist.o icu52/common/uloc_tag.o icu52/common/umapfile.o icu52/common/umath.o icu52/common/unorm_it.o icu52/common/ures_cnv.o icu52/common/uresdata.o icu52/common/usc_impl.o icu52/common/uscript.o icu52/common/ustr_cnv.o icu52/common/ustrfmt.o icu52/common/utf_impl.o icu52/common/utrace.o icu52/common/utypes.o icu52/common/wintz.o icu52/i18n/alphaindex.o icu52/i18n/anytrans.o icu52/i18n/astro.o icu52/i18n/basictz.o icu52/i18n/bocsu.o icu52/i18n/brktrans.o icu52/i18n/buddhcal.o icu52/i18n/calendar.o icu52/i18n/casetrn.o icu52/i18n/cecal.o icu52/i18n/chnsecal.o icu52/i18n/choicfmt.o icu52/i18n/coleitr.o icu52/i18n/coll.o icu52/i18n/compactdecimalformat.o icu52/i18n/coptccal.o icu52/i18n/cpdtrans.o icu52/i18n/csdetect.o icu52/i18n/csmatch.o icu52/i18n/csr2022.o icu52/i18n/csrecog.o icu52/i18n/csrmbcs.o icu52/i18n/csrsbcs.o icu52/i18n/csrucode.o icu52/i18n/csrutf8.o icu52/i18n/curramt.o icu52/i18n/currfmt.o icu52/i18n/currpinf.o icu52/i18n/currunit.o icu52/i18n/dangical.o icu52/i18n/datefmt.o icu52/i18n/dcfmtsym.o icu52/i18n/decfmtst.o icu52/i18n/decimfmt.o icu52/i18n/digitlst.o icu52/i18n/dtfmtsym.o icu52/i18n/dtitvfmt.o icu52/i18n/dtitvinf.o icu52/i18n/dtptngen.o icu52/i18n/dtrule.o icu52/i18n/esctrn.o icu52/i18n/ethpccal.o icu52/i18n/fmtable_cnv.o icu52/i18n/fmtable.o icu52/i18n/format.o icu52/i18n/fphdlimp.o icu52/i18n/fpositer.o icu52/i18n/funcrepl.o icu52/i18n/gender.o icu52/i18n/gregocal.o icu52/i18n/gregoimp.o icu52/i18n/hebrwcal.o icu52/i18n/identifier_info.o icu52/i18n/indiancal.o icu52/i18n/inputext.o icu52/i18n/islamcal.o icu52/i18n/japancal.o icu52/i18n/locdspnm.o icu52/i18n/measfmt.o icu52/i18n/measure.o icu52/i18n/msgfmt.o icu52/i18n/name2uni.o icu52/i18n/nfrs.o icu52/i18n/nfrule.o icu52/i18n/nfsubs.o icu52/i18n/nortrans.o icu52/i18n/nultrans.o icu52/i18n/numfmt.o icu52/i18n/numsys.o icu52/i18n/olsontz.o icu52/i18n/persncal.o icu52/i18n/plurfmt.o icu52/i18n/plurrule.o icu52/i18n/quant.o icu52/i18n/rbnf.o icu52/i18n/rbt_data.o icu52/i18n/rbt_pars.o icu52/i18n/rbt_rule.o icu52/i18n/rbt_set.o icu52/i18n/rbt.o icu52/i18n/rbtz.o icu52/i18n/regexcmp.o icu52/i18n/regeximp.o icu52/i18n/regexst.o icu52/i18n/regextxt.o icu52/i18n/region.o icu52/i18n/reldtfmt.o icu52/i18n/rematch.o icu52/i18n/remtrans.o icu52/i18n/repattrn.o icu52/i18n/scriptset.o icu52/i18n/search.o icu52/i18n/selfmt.o icu52/i18n/simpletz.o icu52/i18n/smpdtfmt.o icu52/i18n/smpdtfst.o icu52/i18n/sortkey.o icu52/i18n/strmatch.o icu52/i18n/strrepl.o icu52/i18n/stsearch.o icu52/i18n/taiwncal.o icu52/i18n/tblcoll.o icu52/i18n/timezone.o icu52/i18n/titletrn.o icu52/i18n/tmunit.o icu52/i18n/tmutamt.o icu52/i18n/tmutfmt.o icu52/i18n/tolowtrn.o icu52/i18n/toupptrn.o icu52/i18n/translit.o icu52/i18n/transreg.o icu52/i18n/tridpars.o icu52/i18n/tzfmt.o icu52/i18n/tzgnames.o icu52/i18n/tznames_impl.o icu52/i18n/tznames.o icu52/i18n/tzrule.o icu52/i18n/tztrans.o icu52/i18n/ucal.o icu52/i18n/ucol_bld.o icu52/i18n/ucol_cnt.o icu52/i18n/ucol_elm.o icu52/i18n/ucol_res.o icu52/i18n/ucol_sit.o icu52/i18n/ucol_tok.o icu52/i18n/ucol_wgt.o icu52/i18n/ucol.o icu52/i18n/ucoleitr.o icu52/i18n/ucsdet.o icu52/i18n/ucurr.o icu52/i18n/udat.o icu52/i18n/udateintervalformat.o icu52/i18n/udatpg.o icu52/i18n/umsg.o icu52/i18n/unesctrn.o icu52/i18n/uni2name.o icu52/i18n/unum.o icu52/i18n/unumsys.o icu52/i18n/upluralrules.o icu52/i18n/uregex.o icu52/i18n/uregexc.o icu52/i18n/uregion.o icu52/i18n/usearch.o icu52/i18n/uspoof_build.o icu52/i18n/uspoof_conf.o icu52/i18n/uspoof_impl.o icu52/i18n/uspoof_wsconf.o icu52/i18n/uspoof.o icu52/i18n/utrans.o icu52/i18n/vtzone.o icu52/i18n/vzone.o icu52/i18n/windtfmt.o icu52/i18n/winnmfmt.o icu52/i18n/wintzimpl.o icu52/i18n/zonemeta.o icu52/i18n/zrule.o icu52/i18n/ztrans.o icu52/i18n/decContext.o icu52/i18n/decNumber.o icu52/i18n/ucln_in.o icu52/i18n/ulocdata.o icu52/i18n/utmscale.o icu52/stubdata/stubdata.o -L/usr/lib64/R/lib -lR'
DBG: Stderr is '* installing *source* package ‘stringi’ ...
** package ‘stringi’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
icu52/i18n/ucol_sit.cpp: In function ‘int32_t ucol_getUnsafeSet_52(const UCollator*, USet*, UErrorCode*)’:
icu52/i18n/ucol_sit.cpp:933: warning: ‘int32_t ucol_getContractions_52(const UCollator*, USet*, UErrorCode*)’ is deprecated (declared at icu52/i18n/ucol_sit.cpp:849)
icu52/i18n/ucol_sit.cpp:933: warning: ‘int32_t ucol_getContractions_52(const UCollator*, USet*, UErrorCode*)’ is deprecated (declared at icu52/i18n/ucol_sit.cpp:849)
installing via 'install.libs.R' to /srv/adzuna/value-my-cv/career_explorer/libs/stringi
downloading ICU data library (icudt)
the files will be extracted to: /srv/adzuna/value-my-cv/career_explorer/libs/stringi/libs
no icudt in a local repo
trying URL 'http://static.rexamine.com/packages/icudt52l.zip'
Content type 'application/zip' length 10154575 bytes (9.7 Mb)
opened URL
==================================================
downloaded 9.7 Mb

icudt fetch OK
decompressing downloaded archive
icudt has been installed successfully
restart R to apply changes
** R
** inst
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded
*

Как мы можем сказать ему искать локальную копию? Выход удобно включает в себя удаленное местоположение (http://static.rexamine.com/packages/icudt52l.zip) поэтому мы можем просто поместить его куда-нибудь сами, но не уверены, где.

может быть, мы об этом совершенно неправильно, но любая помощь или указателей будет приветствоваться.

мы на машинах ubuntu, а также пытались установить libicu42 и libicu-dev, но ни один из них не казался оказывать помощь.

5 ответов



Примечание: для Stringi > = 0.5-1 пожалуйста, проверьте ответ by @gagolews


С установить файл:

пакет stringi зависит от библиотеки ICU4C >= 50.

так libicu42 далеко не старый.

если вы проверяете вы найдете следующие строки:

mirrors <- c("http://static.rexamine.com/packages/",
    "http://www.mini.pw.edu.pl/~gagolews/stringi/",
    "http://www.ibspan.waw.pl/~gagolews/stringi/")

A пару строк позже!--10--> вы найдете что-то вроде этого:

if (!grepl("^https?://", href)) {
    # try to copy icudt from a local repo
    if (!file.exists(href)) return("no icudt in a local repo")

если вы добавляете локальный путь в начале mirrors и поместите загруженные библиотеки, похоже, работает так, как ожидалось. Здесь вы можете патч, который я использовал: https://gist.github.com/zero323/338c8fb0faf46e5ac06d

поэтому мое решение было бы:

  • клон репозитория
  • проверка версии
  • применить патч с путем к локальной версии ОИТ
  • установить пакет из исходников

вероятно, есть лучший способ, но это то, что я придумал до сих пор.


это будет исправлено в предстоящей версии 0.5-1 stringi см. эта функция запрос.

соответствующих переменных окружающей среды (ICUDT_DIR) теперь используется ./configure скрипт для указания каталога, из которого локальная копия icudt должна быть извлечена. Его можно предоставить, например, по телефону:

install.packages("stringi_0.5-1.zip", # assuming that we install from a downloaded archive
    configure.vars="ICUDT_DIR=<dir_to_copy_icudt_from>")

У меня была та же проблема. Что я делал подобное решение, предложенное gagolews. Решение Gagolews не совсем сработало для меня, потому что я не мог найти zip-копию stringi для загрузки. Я загрузил icudt изhttp://static.rexamine.com/packages/icudt52l.zip в папку, скажем /home / tmp / затем я установил из сети, но предоставив локальную копию icudt, введя следующее В R:

install.packages("stringi", # this will install from online
configure.vars="ICUDT_DIR=/home/tmp/") #but use the downloaded version of icudt

это сработало для меня.


  1. клон git clone https://github.com/gagolews/stringi.git.
  2. редактировать .Rbuildignore файл и избавиться от ^src/icu55/data линии.
  3. Run R CMD build stringi_dir_name построить смолы.файл gz.
  4. установить полученные .tar.gz файл на вашем компьютере (- ах), например, via install.packages("stringi_xxx.tar.gz")

эта работа с R-3.2.3 в Linux Mint 17.2. 1. Установите "libicu-dev" из Software Manager. 2. в R : установите.пакеты('стринги')

для получения дополнительной информации попробуйте прочитать эту инструкцию:https://cran.r-project.org/web/packages/stringi/INSTALL