Любой простой способ построить 3D-скаттер в Python, который я могу вращать?

В настоящее время я использую matplotlib для построения 3D-скаттера, и пока он выполняет свою работу, я не могу найти способ повернуть его, чтобы лучше видеть мои данные.

вот пример:

import pylab as p
import mpl_toolkits.mplot3d.axes3d as p3

#data is an ndarray with the necessary data and colors is an ndarray with
#'b', 'g' and 'r' to paint each point according to its class

...

fig=p.figure()
ax = p3.Axes3D(fig)
ax.scatter(data[:,0], data[:,2], data[:,3], c=colors)
ax.set_xlabel('X')
ax.set_ylabel('Y')
ax.set_zlabel('Z')
fig.add_axes(ax)
p.show()

Я хотел бы решение, которое позволяет мне делать это во время выполнения, но пока я могу повернуть его, и он короткий/быстрый, я в порядке.

вот сравнение графиков, полученных после применения PCA к набору данных iris:
1. и mayavi
alt text
2. библиотек matplotlib
alt text

Mayavi упрощает визуализацию данных, но MatPlotLib выглядит более профессионально. Библиотек matplotlib тоже легче.

16
charts matplotlib python scatter-plot

2 ответов

С помощью и mayavi, вы можете создать такой сюжет с

import enthought.mayavi.mlab as mylab
import numpy as np
x, y, z, value = np.random.random((4, 40))
mylab.points3d(x, y, z, value)
mylab.show()

GUI позволяет вращение с помощью щелчка и перетаскивания, а также увеличение / уменьшение масштаба с помощью щелчка правой кнопкой мыши и перетаскивания.

alt text

11

Ну, сначала нужно определить что вы подразумеваете под "видеть мои данные лучше"...

вы можете вращать и приближать сюжет с помощью мыши, Если вы хотите работать в интерактивном режиме.

если вы просто хотите повернуть оси программно, то используйте ax.view_init(elev, azim) здесь elev и azim - углы высоты и Азимута (в градусах), с которых вы хотите просмотреть свой участок.

кроме того, вы можете использовать ax.elev, ax.azim и ax.dist свойства для получения / установки высоты, азимута и расстояния текущей точки обзора.

заимствуя источник С :

import numpy as np
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import matplotlib.pyplot as plt

def randrange(n, vmin, vmax):
    return (vmax-vmin)*np.random.rand(n) + vmin

fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
n = 100
for c, m, zl, zh in [('r', 'o', -50, -25), ('b', '^', -30, -5)]:
    xs = randrange(n, 23, 32)
    ys = randrange(n, 0, 100)
    zs = randrange(n, zl, zh)
    ax.scatter(xs, ys, zs, c=c, marker=m)

ax.set_xlabel('X Label')
ax.set_ylabel('Y Label')
ax.set_zlabel('Z Label')

plt.show()

мы получаем хороший scatterplot: alt text

вы можете вращать оси программно, как показано:

import numpy as np
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import matplotlib.pyplot as plt

def randrange(n, vmin, vmax):
    return (vmax-vmin)*np.random.rand(n) + vmin

fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
n = 100
for c, m, zl, zh in [('r', 'o', -50, -25), ('b', '^', -30, -5)]:
    xs = randrange(n, 23, 32)
    ys = randrange(n, 0, 100)
    zs = randrange(n, zl, zh)
    ax.scatter(xs, ys, zs, c=c, marker=m)

ax.set_xlabel('X Label')
ax.set_ylabel('Y Label')
ax.set_zlabel('Z Label')

ax.azim = 200
ax.elev = -45

plt.show()

alt text

надеюсь, что это поможет немного!

26