Почему ElementTree вызывает ParseError?

Я пытался разобрать файл с помощью xml.etree.ElementTree:

import xml.etree.ElementTree as ET
from xml.etree.ElementTree import ParseError

def analyze(xml):
    it = ET.iterparse(file(xml))
    count = 0
    last = None

    try:        
        for (ev, el) in it:
            count += 1
            last = el

    except ParseError:
            print("catastrophic failure")
            print("last successful: {0}".format(last))

    print('count: {0}'.format(count))

Это конечно упрощенная версия мой код, но этого достаточно, чтобы сломать мою программу. Я получаю эту ошибку с некоторыми файлами, если я удаляю блок try-catch:

Traceback (most recent call last):
  File "<pyshell#22>", line 1, in <module>
    from yparse import analyze; analyze('file.xml')
  File "C:Python27yparse.py", line 10, in analyze
    for (ev, el) in it:
  File "C:Python27libxmletreeElementTree.py", line 1258, in next
    self._parser.feed(data)
  File "C:Python27libxmletreeElementTree.py", line 1624, in feed
    self._raiseerror(v)
  File "C:Python27libxmletreeElementTree.py", line 1488, in _raiseerror
    raise err
ParseError: reference to invalid character number: line 1, column 52459

результаты детерминированы, хотя, если файл работает, он всегда будет работать. Если файл терпит неудачу, он всегда терпит неудачу и всегда терпит неудачу в одной и той же точке.

самое странное, что я использую трассировку, чтобы узнать, если я у любой XML-документ, который ломает парсер. Затем я изолирую узел, вызвавший сбой. Но когда я создаю XML-файл, содержащий этот узел и несколько соседей, парсинг работает!

Это, похоже,не проблема размера. Мне удалось проанализировать гораздо большие файлы без проблем.

какие идеи?

4 ответов


Как предположил @John Machin, в рассматриваемых файлах есть сомнительные числовые объекты, хотя сообщения об ошибках, похоже, указывают на неправильное место в тексте. Возможно, потоковый характер и буферизация затрудняют представление точных позиций.

фактически, все эти сущности появляются в тексте:

set(['&#x08;', '&#x0E;', '&#x1E;', '&#x1C;', '&#x18;', '&#x04;', '&#x0A;', '&#x0C;', '&#x16;', '&#x14;', '&#x06;', '&#x00;', '&#x10;', '&#x02;', '&#x0D;', '&#x1D;', '&#x0F;', '&#x09;', '&#x1B;', '&#x05;', '&#x15;', '&#x01;', '&#x03;'])

большинство не допускаются. Похоже, этот парсер довольно строгий, вам нужно будет найти другой, который не так строг, или предварительная обработка XML.


вот некоторые идеи:

(0) объясните "файл" и "иногда": вы действительно имеете в виду, что он иногда работает и иногда терпит неудачу с то же самое?

выполните следующие действия для каждого сбоя файл:

(1) Узнайте, что находится в файле в тот момент, когда он жалуется:

text = open("the_file.xml", "rb").read()
err_col = 52459
print repr(text[err_col-50:err_col+100]) # should include the error text
print repr(text[:50]) # show the XML declaration

(2) бросьте файл в веб-службу проверки XML, например http://www.validome.org/xml/ или http://validator.aborla.net/

и отредактируйте свой вопрос, чтобы отобразить свои выводы.

обновление: вот минимальный XML-файл, который иллюстрирует вашу проблему:

[badcharref.xml]
<a>&#1;</a>

[Python 2.7.1 output]
>>> import xml.etree.ElementTree as ET
>>> it = ET.iterparse(file("badcharref.xml"))
>>> for ev, el in it:
...     print el.tag
...
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "C:\python27\lib\xml\etree\ElementTree.py", line 1258, in next
    self._parser.feed(data)
  File "C:\python27\lib\xml\etree\ElementTree.py", line 1624, in feed
    self._raiseerror(v)
  File "C:\python27\lib\xml\etree\ElementTree.py", line 1488, in _raiseerror
    raise err
xml.etree.ElementTree.ParseError: reference to invalid character number: line 1, column 3
>>>

не все допустимые символы Юникода допустимы в XML. Вижу XML 1.0 спецификация.

вы можете изучить свои файлы с помощью регулярных выражений, таких как r'&#([0-9]+);' и r'&#x([0-9A-Fa-f]+);', преобразовать сопоставленный текст в порядковый номер int и проверить против действительного списка из спецификации, т. е. #x9 | #xA | #xD | [#x20-#xD7FF] | [#xE000-#xFFFD] | [#x10000-#x10FFFF]

... или, может быть, числовая символьная ссылка синтаксически недействительна, например, не завершается ;', &#not-a-digit etc etc

обновление 2 Я ошибся, число в сообщении об ошибке ElementTree подсчитывает кодовые точки Unicode, а не байты. См. код ниже и фрагменты из выходных данных от запуска его над двумя плохими файлами.

# coding: ascii
# Find numeric character references that refer to Unicode code points
# that are not valid in XML.
# Get byte offsets for seeking etc in undecoded file bytestreams.
# Get unicode offsets for checking against ElementTree error message,
# **IF** your input file is small enough. 

BYTE_OFFSETS = True
import sys, re, codecs
fname = sys.argv[1]
print fname
if BYTE_OFFSETS:
    text = open(fname, "rb").read()
else:
    # Assumes file is encoded in UTF-8.
    text = codecs.open(fname, "rb", "utf8").read()
rx = re.compile("&#([0-9]+);|&#x([0-9a-fA-F]+);")
endpos = len(text)
pos = 0
while pos < endpos:
    m = rx.search(text, pos)
    if not m: break
    mstart, mend = m.span()
    target = m.group(1)
    if target:
        num = int(target)
    else:
        num = int(m.group(2), 16)
    # #x9 | #xA | #xD | [#x20-#xD7FF] | [#xE000-#xFFFD] | [#x10000-#x10FFFF]
    if not(num in (0x9, 0xA, 0xD) or 0x20 <= num <= 0xD7FF
    or 0xE000 <= num <= 0xFFFD or 0x10000 <= num <= 0x10FFFF):
        print mstart, m.group()
    pos = mend

выход:

comments.xml
6615405 &#x10;
10205764 &#x00;
10213901 &#x00;
10213936 &#x00;
10214123 &#x00;
13292514 &#x03;
...
155656543 &#x1B;
155656564 &#x1B;
157344876 &#x10;
157722583 &#x10;

posts.xml
7607143 &#x1F;
12982273 &#x1B;
12982282 &#x1B;
12982292 &#x1B;
12982302 &#x1B;
12982310 &#x1B;
16085949 &#x1C;
16085955 &#x1C;
...
36303479 &#x12;
36303494 &#xFFFF; <<=== whoops
38942863 &#x10;
...
785292911 &#x08;
801282472 &#x13;
848911592 &#x0B;

Я не уверен, что это отвечает на ваш вопрос, но если вы хотите использовать исключение с ParseError, вызванным деревом элементов, вы сделаете это:

except ET.ParseError:
            print("catastrophic failure")
            print("last successful: {0}".format(last))

источник:http://effbot.org/zone/elementtree-13-intro.htm


Я чувствовал, что также может быть важно отметить здесь, что вы можете довольно легко поймать свою ошибку и избежать необходимости полностью остановить свою программу, просто используя то, что вы уже используете позже в функции, разместив свое заявление:

it = ET.iterparse(file(xml))

внутри скобки try & except:

try:
    it = ET.iterparse(file(xml))
except:
    print('iterparse error')

конечно, это не исправит ваш XML-файл или метод предварительной обработки, но может помочь в определении того, какой файл (если вы разбираете много) вызывает вашу ошибку.