правильный способ создания сводной таблицы в postgresql, используя случай, когда

Я пытаюсь создать представление типа сводной таблицы в postgresql и почти там! Вот основной запрос:

select 
acc2tax_node.acc, tax_node.name, tax_node.rank 
from 
tax_node, acc2tax_node 
where 
tax_node.taxid=acc2tax_node.taxid and acc2tax_node.acc='AJ012531';

и данные:

   acc    |          name           |     rank     
----------+-------------------------+--------------
 AJ012531 | Paromalostomum fusculum | species
 AJ012531 | Paromalostomum          | genus
 AJ012531 | Macrostomidae           | family
 AJ012531 | Macrostomida            | order
 AJ012531 | Macrostomorpha          | no rank
 AJ012531 | Turbellaria             | class
 AJ012531 | Platyhelminthes         | phylum
 AJ012531 | Acoelomata              | no rank
 AJ012531 | Bilateria               | no rank
 AJ012531 | Eumetazoa               | no rank
 AJ012531 | Metazoa                 | kingdom
 AJ012531 | Fungi/Metazoa group     | no rank
 AJ012531 | Eukaryota               | superkingdom
 AJ012531 | cellular organisms      | no rank

то, что я пытаюсь сделать, это следующее:

acc      | species                  | phylum
AJ012531 | Paromalostomum fusculum  | Platyhelminthes

Я пытаюсь сделать это с CASE WHEN, поэтому у меня есть следующее:

select 
acc2tax_node.acc, 
CASE tax_node.rank WHEN 'species' THEN tax_node.name ELSE NULL END as species, 
CASE tax_node.rank WHEN 'phylum' THEN tax_node.name ELSE NULL END as phylum 
from 
tax_node, acc2tax_node 
where 
tax_node.taxid=acc2tax_node.taxid and acc2tax_node.acc='AJ012531';

что дает мне выход:

   acc    |         species         |     phylum      
----------+-------------------------+-----------------
 AJ012531 | Paromalostomum fusculum | 
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         | Platyhelminthes
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         |

теперь я знаю, что мне нужно сгруппироваться по acc в какой-то момент, поэтому я пытаюсь 

select 
acc2tax_node.acc, 
CASE tax_node.rank WHEN 'species' THEN tax_node.name ELSE NULL END as sp, 
CASE tax_node.rank WHEN 'phylum' THEN tax_node.name ELSE NULL END as ph 
from 
tax_node, acc2tax_node 
where 
tax_node.taxid=acc2tax_node.taxid and acc2tax_node.acc='AJ012531' 
group by acc2tax_node.acc;

но я получаю страшный 

ERROR:  column "tax_node.rank" must appear in the GROUP BY clause or be used in an aggregate function

все предыдущие примеры, которые я смог найти, используют что-то вроде SUM() вокруг операторов CASE, поэтому я думаю, что это агрегатная функция. Я попытался использовать FIRST ():

select 
acc2tax_node.acc, 
FIRST(CASE tax_node.rank WHEN 'species' THEN tax_node.name ELSE NULL END) as sp, 
FIRST(CASE tax_node.rank WHEN 'phylum' THEN tax_node.name ELSE NULL END) as ph 
from tax_node, acc2tax_node where tax_node.taxid=acc2tax_node.taxid and acc2tax_node.acc='AJ012531' group by acc2tax_node.acc;

но получаю ошибку:

ERROR:  function first(character varying) does not exist

может ли кто-нибудь предложить какие-либо подсказки?

6
case-when pivot pivot-table postgresql sql

6 ответов

используйте MAX () или MIN (), а не FIRST (). В этом случае все нули в столбце для каждого значения группы, за исключением, самое большее, один с not null значение. По определению, это MIN и MAX этого набора значений (все нули исключены).

5

PostgreSQL имеет несколько функций для сводных запросов, см. Эту статью в Postgresonline. Вы можете найти эти функции в contrib.

2
SELECT  atn.acc, ts.name AS species, tp.name AS phylum
FROM    acc2tax_node atn
LEFT JOIN
        tax_node ts
ON      ts.taxid = atn.taxid
        AND ts.rank = 'species'
LEFT JOIN
        tax_node tp
ON      tp.taxid = atn.taxid
        AND tp.rank = 'phylum'
WHERE   atn.acc = 'AJ012531 '
0

дополнительная информация по запросу (в ответе, а не в комментарии для хорошего форматирования):

SELECT * FROM acc2tax_node WHERE acc = 'AJ012531';

   acc    | taxid  
----------+--------
 AJ012531 |  66400
 AJ012531 |  66399
 AJ012531 |  39216
 AJ012531 |  39215
 AJ012531 | 166235
 AJ012531 | 166384
 AJ012531 |   6157
 AJ012531 |  33214
 AJ012531 |  33213
 AJ012531 |   6072
 AJ012531 |  33208
 AJ012531 |  33154
 AJ012531 |   2759
 AJ012531 | 131567
0

выполнить:

SELECT report.* FROM crosstab(
 select 
 acc2tax_node.acc, tax_node.name, tax_node.rank 
 from 
 tax_node, acc2tax_node 
 where 
 tax_node.taxid=acc2tax_node.taxid and acc2tax_node.acc='AJ012531';
) AS report(species text, enus text, family text, ...)
0

Как указал Мэтью Вуд, используйте MIN () или MAX (), а не FIRST ():

SELECT 
    an.acc, 
    MAX(
        CASE tn.rank 
            WHEN 'species' THEN tn.name 
            ELSE NULL 
        END
    ) AS species, 
    MAX(
        CASE tn.rank 
            WHEN 'phylum' THEN tn.name 
            ELSE NULL 
        END
    ) AS phylum 
FROM tax_node tn, 
    acc2tax_node an
WHERE tn.taxid = an.taxid 
    and an.acc = 'AJ012531' 
GROUP by an.acc;
0