R ошибка в glmnet: NA/NaN / Inf во внешнем вызове функции
Я пытаюсь создать модель с помощью glmnet (в настоящее время используя cv, чтобы найти значение лямбда), и я получаю ошибку NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 5)
. Я считаю, что это имеет какое-то отношение к значениям NA в моем наборе данных, потому что когда я удаляю все точки данных с NAs, команда запускается успешно.
у меня сложилось впечатление, что glmnet можете обрабатывать значения NA. Я не уверен, откуда исходит ошибка:
> res <- cv.glmnet(features.mat, as.factor(tmp[,"outcome"]), family="binomial")
Error in lognet(x, is.sparse, ix, jx, y, weights, offset, alpha, nobs, :
NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 5)
набор данных выглядит примерно так это:
> head(features.mat)
6 x 8 sparse Matrix of class "dgCMatrix"
a b c e f g h i
1 1 1 138 NA NA 15 NA .
4 1 3 171 NA NA 17 NA .
7 1 1 156 NA NA 5 NA .
8 1 4 97 NA NA 7 NA .
9 1 1 219 NA NA 11 NA .
10 1 . 263 NA NA 20 NA .
> head(as.factor(tmp[,"outcome"]))
[1] 0 0 0 0 0 0
Levels: 0 1