R столбчатая гистограмма построение текста Геом

Я пытаюсь построить столбчатую гистограмму в R с помощью ggplot. Я также хочу включить процент в каждую часть баров для этой части. Я пытался следить за сообщениями 1, 2, 3 но значения точно не находятся в соответствующих блоках. Мои данные-это файл в в Dropbox.

мой код выглядит следующим образом:

f<-read.table("Input.txt", sep="t", header=TRUE)

ggplot(data=f, aes(x=Form, y=Percentage, fill=Position)) + 
    geom_bar(stat="identity", colour="black") + 
    geom_text(position="stack", aes(x=Form, y=Percentage, ymax=Percentage, label=Percentage, hjust=0.5)) + 
    facet_grid(Sample_name ~ Sample_type, scales="free", space="free") + 
    opts(title = "Input_profile", 
         axis.text.x = theme_text(angle = 90, hjust = 1, size = 8, colour = "grey50"), 
         plot.title = theme_text(face="bold", size=11), 
         axis.title.x = theme_text(face="bold", size=9), 
         axis.title.y = theme_text(face="bold", size=9, angle=90),
         panel.grid.major = theme_blank(), 
         panel.grid.minor = theme_blank()) + 
    scale_fill_hue(c=45, l=80)

ggsave("Output.pdf")

выход-

enter image description here

любая помощь значительно оцененный. Спасибо за помощь и время!

9
ggplot2 r

2 ответов

Я думаю, вы используете более старую версию ggplot2. Потому что с вашим кодом, измененным для ggplot2 v 0.9.3, я получаю следующее:

p <- ggplot(data = df, aes(x = Form, y = Percentage, fill = Position))
p <- p + geom_bar(stat = "identity", colour = "black")
p <- p + geom_text(position = "stack", aes(x = Form, y = Percentage, ymax = Percentage, label = Percentage, hjust = 0.5))
p <- p + facet_grid(Sample_name ~ Sample_type, scales="free", space="free")
p <- p + theme(plot.title = element_text("Input_profile"), 
         axis.text.x = element_text(angle = 90, hjust = 1, size = 8, colour = "grey50"), 
         plot.title = element_text(face="bold", size=11), 
         axis.title.x = element_text(face="bold", size=9), 
         axis.title.y = element_text(face="bold", size=9, angle=90),
         panel.grid.major = element_blank(), 
         panel.grid.minor = element_blank())
p <- p + scale_fill_hue(c=45, l=80)
p

ggplot2_text_placement

вы видите, что текстовые объекты обычно правильно. Есть места, где бары слишком короткие, так что числа перекрываются. Вы также можете играть с

10

здесь решение с использованием barchart от решетки.

enter image description here

library(latticeExtra)
barchart(Percentage~Form|Sample_type*Sample_name,data=dat,
         groups =Position,stack=T,
         panel=function(...){
           panel.barchart(...)
           ll <- list(...)
           keep <- !is.na(ll$groups[ll$subscripts])
           x <- as.numeric(ll$x[keep])
           y <- as.numeric(ll$y[keep])
           groups <- as.numeric(factor(ll$groups)[ll$subscripts[keep]])
           for (i in unique(x)) {
               ok <- x == i
               ord <- sort.list(groups[ok])
               pos <- y[ok][ord] > 0
               nok <- sum(pos, na.rm = TRUE)
               h <- y[ok][ord][pos]
               panel.text(x = rep(i, nok),y = cumsum(h)-0.5*h,
                          label = h,cex=1.5)
             }
         },
         auto.key = list(columns = 5), 
         par.settings = ggplot2like(n = 5),
         lattice.options = ggplot2like.opts())
5