scatterplot с xerr и yerr с matplotlib

Я ищу, чтобы визуализировать позиции двух массивов друг с другом. Мой стол выглядит так 

    Number          Description      value_1  value_2  err_1 err_2
         1          descript_1       124.46   124.46   22.55  54.2
         2          Descript_2       8.20     50.2     0.37   0.1 
         3          Descript_2       52.55    78.3     3.77   2.41
         4          Descript_2       4.33     778.8    0.14   1.78

то, что я в основном хочу, это что-то вроде этого: scatterplot with two errorbars

таким образом, на этом графике каждая точка имеет в основном три свойства: 1. xerror bar 2. yerror bar 3. описание того, что представляет эта точка.

У меня такое чувство, что это можно сделать элегантно с matplotlib, и пока я пробовал некоторые вещи с errorbars, которые не совсем дали мне то, что я ожидал. И я еще не выяснил, как разместить подписи к сюжету.

7
matplotlib plot python

2 ответов

похоже, вы хотите что-то вроде этого?

import matplotlib.pyplot as plt

x = [124.46, 8.20, 52.55, 4.33]
y = [124.46, 50.2, 78.3, 778.8]
xerr = [54.2, 0.1, 2.41, 1.78]
yerr = [22.55, 0.37, 3.77, 0.14]

descrip = ['Atom 1', 'Atom 2', 'Atom 3', 'Atom 4']


plt.errorbar(x, y, xerr, yerr, capsize=0, ls='none', color='black', 
            elinewidth=2)

for xpos, ypos, name in zip(x, y, descrip):
    plt.annotate(name, (xpos, ypos), xytext=(8, 8), va='bottom',
                textcoords='offset points')

plt.show()

enter image description here

errorbar работает так же, как plot. Если вы хотите" разброс " сюжет, то вам нужно указать linestyle='none' (или ls='none'). Основываясь на вашем рисунке, вы не хотите шапки на errorbars, поэтому я указал capsize=0. Аналогично, вы, похоже, хотите довольно толстые линии для errorbars, таким образом elinewidth=2.

если вы хотите маркер в дополнение к errorbars, просто укажите marker='o' (или любой стиль маркера вы хотели бы) к errorbar.

annotate это самый простой способ аннотировать точки На графике. Здесь я указал, что аннотация должна быть размещена 8 точки выше и справа от каждого измерения.

8

не 

import matplotlib.pyplot as plt

x = [100, 200, 300, 400]
y = [100, 200, 300, 400]
xerr = [100, 100, 100, 100]
yerr = [20, 20, 20, 20]

plt.errorbar(x, y, xerr, yerr, ls='none')
plt.show()

имею в виду бары ошибка не в той оси?

pyplot.errorbar:

matplotlib.pyplot.errorbar(x, y, yerr=None, xerr=None, fmt=u'', ecolor=None, elinewidth=None, capsize=3, barsabove=False, lolims=False, uplims=False, xlolims=False, xuplims=False, errorevery=1, capthick=None, hold=None, **kwargs)

обратите внимание, что yerr предшествует xerr, поэтому

plt.errorbar(x, y, xerr, yerr, ls='none')

делает ваши бары ошибок назад-yerr=xerr, xerr=yerr. Хорошее время для использования именованных args:

plt.errorbar(x, y, xerr=xerr, yerr=yerr, ls='none')
0