SED или AWK заменяют все шаблонами из другого файла

попробуйте этот . Должно быть быстро.

$ sed -f <(printf 's/%s/%s/g\n' $(<patterns.txt)) contents.txt

это форматирует данные шаблонов.txt как bellow без фактического изменения шаблонов.тхт реальное содержание:

$ printf 's/%s/%s/g\n' $(<patterns.txt)
s/1000000001/9000000003/g
s/1000000002/2000000001/g
s/1000000003/3000000001/g
s/1000000004/4000000001/g
s/1000000005/5000000001/g

все вышеперечисленное затем дается с заменой процесса <(...) простой sed в качестве файла сценария с помощью
sed -f switch = чтение команд sed из файла

$ sed -f <(printf 's/%s/%s/g\n' $(<patterns.txt)) contents.txt
288Y2RZDBPX9000000003dhana
JP2F64EI2000000001d
EU9V3IXI3000000001dfg9000000003dfdfds
XATSSSSFOO4dhanaUXIBB7TF74000000001adf
10Q1W4ZEAV18LXNPSPGRTTIDHBN5000000001egw

не могли бы вы попробовать следующие awk и дайте мне знать, если это помогает вам.

Решение 1-й:

awk 'FNR==NR{a[]=;next}   {for(i in a){match(,i);val=substr(,RSTART,RLENGTH);if(val){sub(val,a[i])}};print}' patterns.txt  sample_content.txt

выход будет следующим образом.

288Y2RZDBPX9000000003dhana
JP2F64EI2000000001d
EU9V3IXI3000000001dfg9000000003dfdfds
XATSSSSFOO4dhanaUXIBB7TF74000000001adf
10Q1W4ZEAV18LXNPSPGRTTIDHBN5000000001egw

объяснение решения 1-го: добавление объяснения тоже теперь здесь:

awk '
FNR==NR{                           ##FNR==NR is a condition which will be TRUE when only first Input_file patterns.txt is being read.
                                   ##FNR and NR both represents line number of Input_file(s) where FNR value will be RESET when a new Input_file is getting read on the other hand NR value will be keep increasing till all Input_file(s) read.
  a[]=;                        ##creating an array a whose index is first field of line and value is 2nd field of current line.
  next                             ##next will skip all further statements for now.
}
{
for(i in a){                       ##Starting a for loop which traverse through array a all element.
  match(,i);                     ##Using match function of awk which will try to match index if array a present in variable i.
  val=substr(,RSTART,RLENGTH);   ##Creating a variable named val which contains the substring of current line substring starts from value of variable RSTART till RLENGTH value.
  if(val){                         ##Checking condition if variable val is NOT NULL then do following:
    sub(val,a[i])}                 ##using sub function of awk to substitute variable val value with array a value of index i.
};
  print                            ##Using print here to print the current line either changed or not changed one.
}
' patterns.txt  sample_content.txt ##Mentioning the Input_file(s) name here.

решение 2-й: без прохождения все время массива, как первое решение, выходящее из массива, когда соответствие найдено как следует:

awk '
FNR==NR{                           ##FNR==NR is a condition which will be TRUE when only first Input_file patterns.txt is being read.
                                   ##FNR and NR both represents line number of Input_file(s) where FNR value will be RESET when a new Input_file is getting read on the other hand NR value will be keep increasing till all Input_file(s) read.
  a[]=;                        ##creating an array a whose index is first field of line and value is 2nd field of current line.
  next                             ##next will skip all further statements for now.
}
{
for(i in a){                       ##Starting a for loop which traverse through array a all element.
  match(,i);                     ##Using match function of awk which will try to match index if array a present in variable i.
  val=substr(,RSTART,RLENGTH);   ##Creating a variable named val which contains the substring of current line substring starts from value of variable RSTART till RLENGTH value.
  if(val){                         ##Checking condition if variable val is NOT NULL then do following:
    sub(val,a[i]);print;next}                 ##using sub function of awk to subsitute variable val value with array a value of index i.
};
}
1
' patterns.txt  sample_content.txt ##Mentioning the Input_file(s) name here.

простой подход-это:

$ cat tst.awk
NR==FNR {
    map[] = 
    next
}
{
    for (old in map) {
        gsub(old,map[old])
    }
    print
}

$ awk -f tst.awk patterns.txt sample_content.txt
288Y2RZDBPX9000000003dhana
JP2F64EI2000000001d
EU9V3IXI3000000001dfg9000000003dfdfds
XATSSSSFOO4dhanaUXIBB7TF74000000001adf
10Q1W4ZEAV18LXNPSPGRTTIDHBN5000000001egw

как и другие решения, опубликованные до сих пор, это относится к каждой подстановке ко всей строке и поэтому задано sample_content.тхт, содержащий xay и узоры.txt, в том числе a b и b c, тогда инструменты будут выводить xcy, а не xby.

в качестве альтернативы вы можете попробовать это:

$ cat tst.awk
NR==FNR {
    map[] = 
    re = re sep 
    sep = "|"
    next
}
{
    head = ""
    tail = 
    while ( match(tail,re) ) {
        head = head substr(tail,1,RSTART-1) map[substr(tail,RSTART,RLENGTH)]
        tail = substr(tail,RSTART+RLENGTH)
    }
    print head tail
}

$ awk -f tst.awk patterns.txt sample_content.txt
288Y2RZDBPX9000000003dhana
JP2F64EI2000000001d
EU9V3IXI3000000001dfg9000000003dfdfds
XATSSSSFOO4dhanaUXIBB7TF74000000001adf
10Q1W4ZEAV18LXNPSPGRTTIDHBN5000000001egw

этот подход имеет ряд преимуществ:

1. он выводит xby (который что я подозреваю, вы действительно хотите, если бы такая ситуация возникла) в случае, я упоминаю выше
2. это не столько выражение сравнения на линию sample_content.txt, как может соответствовать вместо 1 в строке шаблонов.txt для каждой строки sample_content.txt
3. он работает только на том, что осталось от линии после предыдущей замены, поэтому тестируемая строка продолжает сжиматься
4. это не меняет и поэтому awk не нужно перекомпилировать и повторно разбить это запись с каждым subsitution.

так и должно быть много быстрее, чем исходный скрипт, предполагающий регулярное выражение, построенное из шаблонов.txt не так огромен, он вызывает снижение производительности только по размеру.