Влияние количества полей таблицы на производительность.

>Быстрее ли будет работать выборка из каждой таблицы отдельно?
Если запрос будет выбирать колонки только из одной таблицы, то быстрее, но лишь на 0.1% или около того. Да и то при условии, что база поднимает данные с жесткого диска, а не из памяти и не флеш-диска. Основная часть времени, как мне кажется, уйдет на чтение полей. Если они расположены близко, это сократит время поиска (average seek time). Теоретически.

Если вам понадобятся поля из разных таблиц, то таблицы придется соединять через join. Это замедлит выборку процентов на 50%. Кроме того, вам нужен будет для каждой таблицы отдельный индекс (хотя бы тот, что на первичном ключе), чтобы эффективно выбирать и соединять строки. Тогда места под индексы нужно в 2-3 раза больше. Так как индексы обычно кешируются в памяти, это съест еще и памяти во столько же раз больше. Даже если вы не выбираете поля из двух таблиц сразу, эта память все-равно уже съедена.

Плюс проблемы с поддержкой контроля целостности. И общее усложнение архитектуры и соответственно сложность поддержки. Необходимость выбора таблицы, в зависимости от полей и прочего. Необходимость вместо одного insert производить два или три в одной транзакции. И т.п.