Инициализация вектора ublas из массива C

Я пишу расширение Matlab, используя библиотеку C++ ublas, и я хотел бы иметь возможность инициализировать мои векторы ublas из массивов C, переданных интерпетером Matlab. Как я могу инициализировать вектор ublas из массива C без (ради эффективности) явного копирования данных. Я ищу что-то по следующим строкам кода:

using namespace boost::numeric::ublas;

int pv[10] = { 5, 5, 5, 5, 5, 5, 5, 5, 5, 5 };
vector<int> v (pv);

В общем, можно ли инициализировать C++ std::vector из массива? Что-то вроде это:

#include <iostream>
#include <vector>
using namespace std;

int main()
{
    int pv[4] = { 4, 4, 4, 4};
    vector<int> v (pv, pv+4);

    pv[0] = 0;
    cout << "v[0]=" << v[0] << " " << "pv[0]=" << pv[0] << endl;

    return 0;
}

но где инициализация не будет копировать данные. В этом случае вывод будет 

v[0]=4 pv[0]=0

но я хочу, чтобы выходные данные были одинаковыми, где обновление массива C изменяет данные, на которые указывает вектор c++

v[0]=0 pv[0]=0
6
c++ matlab ublas vector

6 ответов

и std::vector и ublas::vector контейнеры. Весь смысл контейнеров заключается в управлении хранением и временем жизни содержащихся в них объектов. Вот почему при инициализации они должны копировать значения в собственное хранилище.

массивы C-это области памяти, фиксированные по размеру и местоположению, поэтому по своей природе вы можете получить их значения только в контейнер путем копирования.

вы можете использовать массивы C в качестве входных данных для многих функций алгоритма, поэтому, возможно, вы можете сделать это избежать первоначальной копии?

6

Я не уверен, как ваш вопрос относится к MATLAB / MEX, но Примечание, Вы можете знать, что MATLAB реализует копирование при записи стратегии.

это означает, что при копировании массива, например, копируются только некоторые заголовки, а сами данные совместно используются между двумя массивами. И как только один из них будет изменен, копия данных будет фактически сделана.

ниже приведено моделирование того, что может происходить под капотом (заимствовано из этого старый пост):

-----------------------------------------
>> a = [35.7 100.2 1.2e7];

 mxArray a
    pdata -----> 35.7 100.2 1.2e7
  crosslink=0

-----------------------------------------
>> b = a;

 mxArray a
    pdata -----> 35.7 100.2 1.2e7
  crosslink     / \
    |  / \       |
    |   |        |
    |   |        |
   \ /  |        |
   crosslink     |
 mxArray b       |
    pdata --------

-----------------------------------------
>> a(1) = 1;

mxArray a
    pdata -----> (1) 100.2 1.2e7
  crosslink=0


   crosslink=0
 mxArray b
    pdata ------> 35.7 100.2 1.2e7 ...

Я знаю, что это не отвечает на ваш вопрос, я просто подумал, что вы можете найти концепцию полезной.

8

вы можете легко инициализировать std::vector из массива C:

vector<int> v(pv, pv+10);
4

в хранилище uBLAS есть два недокументированных класса.ТЭЦ. Вы можете изменить класс хранения по умолчанию (unbounded_array) в ublas::vector с помощью одного из них.

  • первый класс, array_adaptor, делает копию ваших данных, когда ublas:: vector вызывает конструктор копирования, не очень полезный класс вообще. Я бы предпочел просто соответствующий конструктор для этого в unbounded_array или bounded_array классах.
  • второе, shallow_array_adaptor, держите только ссылку на свои данные, поэтому вы можете использовать vector для прямого изменения вашего массива C. К сожалению, у него есть некоторые ошибки, когда вы назначаете выражение, оно теряет исходный указатель данных. Но вы можете создать производный класс, который исправит эту проблему.

вот патч и пример:

// BOOST_UBLAS_SHALLOW_ARRAY_ADAPTOR must be defined before include vector.hpp
#define BOOST_UBLAS_SHALLOW_ARRAY_ADAPTOR

#include <boost/numeric/ublas/vector.hpp>
#include <algorithm>
#include <iostream>

// Derived class that fix base class bug. Same name, different namespace.    
template<typename T>
class shallow_array_adaptor
: public boost::numeric::ublas::shallow_array_adaptor<T>
{
public:
   typedef boost::numeric::ublas::shallow_array_adaptor<T> base_type;
   typedef typename base_type::size_type                   size_type;
   typedef typename base_type::pointer                     pointer;

   shallow_array_adaptor(size_type n) : base_type(n) {}
   shallow_array_adaptor(size_type n, pointer data) : base_type(n,data) {}
   shallow_array_adaptor(const shallow_array_adaptor& c) : base_type(c) {}

   // This function must swap the values ​​of the items, not the data pointers.
   void swap(shallow_array_adaptor& a) {
      if (base_type::begin() != a.begin())
         std::swap_ranges(base_type::begin(), base_type::end(), a.begin());
   }
};

void test() {
    using namespace boost::numeric;
    typedef ublas::vector<double,shallow_array_adaptor<double> > vector_adaptor;

    struct point {
        double x;
        double y;
        double z;
    };

    point p = { 1, 2, 3 };
    vector_adaptor v(shallow_array_adaptor<double>(3, &p.x));

    std::cout << p.x << ' ' << p.y << ' ' << p.z << std::endl;
    v += v*2.0;
    std::cout << p.x << ' ' << p.y << ' ' << p.z << std::endl;
}

выход:

1 2 3
3 6 9
4

вот пара функций для синтаксически удобного назначения (по общему признанию, не инициализации):

vector<int> v;
setVector(v, 3, 
          1, 2, 3);

matrix<int> m;
setMatrix(m, 3, 4,
            1,   2,   3,   4,
           11,  22,  33,  44,
          111, 222, 333, 444);

функции:

/**
 * Resize a ublas vector and set its elements
 */
template <class T> void setVector(vector<T> &v, int n, ...)
{
    va_list ap;
    va_start(ap, n);
    v.resize(n);
    for (int i = 0; i < n; i++) {
        v[i] = va_arg(ap, T);
    }
    va_end(ap);
}

/**
 * Resize a ublas matrix and set its elements
 */
template <class T> void setMatrix(matrix<T> &m, int rows, int cols ...)
{
    va_list ap;
    va_start(ap, cols);
    m.resize(rows, cols);
    for (int i = 0; i < rows; i++) {
        for (int j = 0; j < cols; j++) {
            m(i, j) = va_arg(ap, T);
        }
    }
    va_end(ap);
}
3

обычное предложение использовать shallow array adaptor кажется мне саркастичным - иметь возможность просто получить доступ к массиву через указатель, который вы должны поместить в shared_array со всеми ссылками, подсчитывающими shebang (это ни к чему, так как вы не владеете массивом), и более того, с кошмаром сглаживания данных. Собственно, uBLAS имеет полноценную реализацию хранилища (array_adaptor), который позволяет использовать векторы с внешними массивами C. Единственный улов-вектор конструктор, который делает копию. Почему эта приятная функция не используется в библиотеке, мне совершенно непонятно, но в любом случае мы можем использовать небольшое расширение (на самом деле это 2 строки кода, окруженные обычным c++ bloat)

template<class T>
class extarray_vector :
    public vector<T, array_adaptor<T> >
{
    typedef vector<T, array_adaptor<T> > vector_type;
public:
    BOOST_UBLAS_INLINE
    extarray_vector(size_type size, pointer p)
    { data().resize(size, p); }

    template <size_type N>
    BOOST_UBLAS_INLINE
    extarray_vector(T (&a)[N])
    { data().resize(N, a); }

    template<class V>
    BOOST_UBLAS_INLINE
    extarray_vector& operator = (const vector<T, V>& v)
    {
        vector_type::operator = (v);
        return *this;
    }

    template<class VC>
    BOOST_UBLAS_INLINE
    extarray_vector& operator = (const vector_container<VC>& v)
    {
        vector_type::operator = (v);
        return *this;
    }

    template<class VE>
    BOOST_UBLAS_INLINE
    extarray_vector& operator = (const vector_expression<VE>& ae)
    {
        vector_type::operator = (ae);
        return *this;
    }
};

вы можете использовать его как это:

int i[] = {1, 4, 9, 16, 25, 36, 49};
extarray_vector<int> iv(i);
BOOST_ASSERT_MSG(i == &iv[0], "Vector should attach to external array\n");
iv[3] = 100;
BOOST_ASSERT(i[3] == 100);
iv.resize(iv.size() + 1, true);
BOOST_ASSERT_MSG(i != &iv[0], "And detach from the array on resize\n");
iv[3] = 200;
BOOST_ASSERT(i[3] == 100);
iv.data().resize(7, i, 0);
BOOST_ASSERT_MSG(i == &iv[0], "And attach back to the array\n");
BOOST_ASSERT(i[3] == 200);

вы можете динамически присоединять и отсоединять вектор к внешнему хранилищу с помощью метода изменения размера array_adaptor (сохранение или удаление данных). При изменении размера он автоматически отсоединяется от хранилища и становится обычным вектором. Назначение из контейнеров идет непосредственно в хранилище, но назначение из выражения выполняется через временное и вектор отсоединяется от хранилища, используйте noalias() чтобы предотвратить это. В конструкторе есть небольшие накладные расходы, так как data_ является частным членом, и мы должны по умолчанию инициализировать его новым T[0], а затем переназначить внешний массив. Вы можете изменить его на защищенный и назначить хранилище непосредственно в конструкторе.

3