Matplotlib 2.0 полосы в гистограмме

Я получаю вертикальные полосы между ячейками при создании гистограммы с matplotlib 2.0.2, python2.7, Win7, 64bit, видимый как в pdf, так и в png. Я usig pgf с latex для создания PDF, который я буду использовать includegraphics в документе pdflatex. Созданный PNG - это просто быстрая проверка.

этого не было в Matplotlib 1.5.3. как мне избавиться от этих белых линий, отделяющих отдельные ящики?

вещи попробовал:

  • включение/выключение сглаживания (aa=True / False в команде hist)
  • рисование линии (ls="-"/ls="none" в команде hist)
  • одна вещь, которая будет работать, дает ширину бункеров (width=2.3), но это также не работает для PDF во всех значениях масштабирования.

код для создания изображения

import matplotlib as mpl
mpl.use('pgf')
pgf_with_latex = {                      # setup matplotlib to use latex for output
    "pgf.texsystem": "pdflatex",        # change this if using xetex or lautex
    "text.usetex": True,                # use LaTeX to write all text
    "font.family": "serif",
    "font.serif": [],                   # blank entries should cause plots to inherit fonts from the document
    "font.sans-serif": [],
    "font.monospace": [],
    "axes.labelsize": 10,               # LaTeX default is 10pt font.
    "font.size": 8,
    "legend.fontsize": 7,               # Make the legend/label fonts a little smaller
    "xtick.labelsize": 7,
    "ytick.labelsize": 7,
    "pgf.preamble": [
        r"usepackage[utf8x]{inputenc}",    # use utf8 fonts becasue your computer can handle it :)
        r"usepackage[T1]{fontenc}",        # plots will be generated using this preamble
        r"usepackage{siunitx}",
        r"DeclareSIUnit[number-unit-product = {}] ",
        r"LSB{LSB}",
        ]
    }
mpl.rcParams.update(pgf_with_latex)

import matplotlib.pyplot as pl
import numpy as np

fig=pl.figure(figsize=(3,2))

ax1 = fig.add_subplot(111)
dat=np.random.normal(-120-60,40,200000).astype(int)
bins=np.arange(int(np.amin(dat))-.5,127.5,2)
ax1.hist(dat, bins = bins, stacked = True)
ax1.set_title("emph{(a)} minimal example")
ax1.set_yscale("log", nonposy="clip")
ax1.set_ylim(0.8, 20000)
ax1.set_xlim(None, 130)
ax1.set_ylabel("frequency")
ax1.set_xlabel("data")
ax1.set_xticks([-300,-200, -127,0,127])
fig.tight_layout(h_pad=1,w_pad=0.2)

pl.savefig('test.png', bbox_inches='tight',dpi=600)
pl.savefig('test.pdf', bbox_inches='tight',dpi=600)

вывод вышеуказанного кода:
output of the above code

1 ответов


1. Не использовать PGF backend

как указал @unutbu в своем (к сожалению, теперь удален) ответе, не использование бэкэнда pgf фактически приведет к ожидаемому сюжету.

удалив строку

mpl.use('pgf')

даст

enter image description here

2. Функция шага

если по какой-то причине нельзя избежать использования бэкэнда pgf, обходным путем может быть использование функции step для построения гистограммы. Удаление ax1.hist(...) из кода и замена его на

hist, ex = np.histogram(dat, bins = bins)
ax1.fill_between(bins[:-1], hist, lw=0.0, step="post")

дает

enter image description here