Matplotlib перекрывающиеся аннотации / текст

Я пытаюсь остановить перекрытие текста аннотации в моих графиках. Метод, предложенный в принятом ответе на библиотек matplotlib перекрывающиеся аннотации выглядит чрезвычайно многообещающим, однако для гистограмм. У меня возникли проблемы с преобразованием методов "оси" в то, что я хочу сделать, и я не понимаю, как строится текст.

import sys
import matplotlib.pyplot as plt


# start new plot
plt.clf()
plt.xlabel("Proportional Euclidean Distance")
plt.ylabel("Percentage Timewindows Attended")
plt.title("Test plot")

together = [(0, 1.0, 0.4), (25, 1.0127692669427917, 0.41), (50, 1.016404709797609, 0.41), (75, 1.1043426359673716, 0.42), (100, 1.1610446924342996, 0.44), (125, 1.1685687930691457, 0.43), (150, 1.3486407784550272, 0.45), (250, 1.4013999168008104, 0.45)]
together.sort()

for x,y,z in together:
    plt.annotate(str(x), xy=(y, z), size=8)

eucs = [y for (x,y,z) in together]
covers = [z for (x,y,z) in together]

p1 = plt.plot(eucs,covers,color="black", alpha=0.5)

plt.savefig("test.png")

изображений (если это работает) можно найти здесь (этот код):

image1

и здесь (более сложный):

image2

26
annotate matplotlib python

2 ответов

Я просто хотел опубликовать здесь другое решение, небольшую библиотеку, которую я написал для реализации такого рода вещей:https://github.com/Phlya/adjustText Пример процесса можно увидеть здесь: enter image description here

вот пример изображения:

import matplotlib.pyplot as plt
from adjustText import adjust_text
import numpy as np
together = [(0, 1.0, 0.4), (25, 1.0127692669427917, 0.41), (50, 1.016404709797609, 0.41), (75, 1.1043426359673716, 0.42), (100, 1.1610446924342996, 0.44), (125, 1.1685687930691457, 0.43), (150, 1.3486407784550272, 0.45), (250, 1.4013999168008104, 0.45)]
together.sort()

text = [x for (x,y,z) in together]
eucs = [y for (x,y,z) in together]
covers = [z for (x,y,z) in together]

p1 = plt.plot(eucs,covers,color="black", alpha=0.5)
texts = []
for x, y, s in zip(eucs, covers, text):
    texts.append(plt.text(x, y, s))

plt.xlabel("Proportional Euclidean Distance")
plt.ylabel("Percentage Timewindows Attended")
plt.title("Test plot")
adjust_text(texts, only_move='y', arrowprops=dict(arrowstyle="->", color='r', lw=0.5))
plt.show()

enter image description here

если вы хотите идеальную фигуру,вы можете немного поиграть. Во-первых, давайте также сделаем текст отталкивающим строки - для этого мы просто создадим много виртуальные точки вдоль них с помощью scipy.интерполировать.interp1d.

мы хотим избежать перемещения меток вдоль оси x, потому что, ну, почему бы не сделать это в иллюстративных целях. Для этого мы используем параметр only_move={'points':'y', 'text':'y'}. Если мы хотим переместить их вдоль оси x только в том случае, если они перекрываются с текстом, используйте move_only={'points':'y', 'text':'xy'}. Также в начале функция выбирает оптимальное выравнивание текстов относительно их исходных точек, поэтому мы хотим, чтобы это происходило только вдоль оси y, следовательно autoalign='y'. Мы также уменьшаем силу отталкивания от точек, чтобы текст не летел слишком далеко из-за нашего искусственного избегания линий. Все вместе:

from scipy import interpolate
p1 = plt.plot(eucs,covers,color="black", alpha=0.5)
texts = []
for x, y, s in zip(eucs, covers, text):
    texts.append(plt.text(x, y, s))

f = interpolate.interp1d(eucs, covers)
x = np.arange(min(eucs), max(eucs), 0.0005)
y = f(x)    

plt.xlabel("Proportional Euclidean Distance")
plt.ylabel("Percentage Timewindows Attended")
plt.title("Test plot")
adjust_text(texts, x=x, y=y, autoalign='y',
            only_move={'points':'y', 'text':'y'}, force_points=0.15,
            arrowprops=dict(arrowstyle="->", color='r', lw=0.5))
plt.show()

enter image description here

56

С большим количеством скрипки, я понял это. Опять же кредит на оригинальное решение идет на ответ для библиотек matplotlib перекрывающиеся аннотации .

Я не знаю, как найти точную ширину и высоту текста. Если кто-то знает, пожалуйста, опубликуйте улучшение (или добавьте комментарий с помощью метода). 
import sys
import matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

def get_text_positions(text, x_data, y_data, txt_width, txt_height):
    a = zip(y_data, x_data)
    text_positions = list(y_data)
    for index, (y, x) in enumerate(a):
        local_text_positions = [i for i in a if i[0] > (y - txt_height) 
                            and (abs(i[1] - x) < txt_width * 2) and i != (y,x)]
        if local_text_positions:
            sorted_ltp = sorted(local_text_positions)
            if abs(sorted_ltp[0][0] - y) < txt_height: #True == collision
                differ = np.diff(sorted_ltp, axis=0)
                a[index] = (sorted_ltp[-1][0] + txt_height, a[index][1])
                text_positions[index] = sorted_ltp[-1][0] + txt_height*1.01
                for k, (j, m) in enumerate(differ):
                    #j is the vertical distance between words
                    if j > txt_height * 2: #if True then room to fit a word in
                        a[index] = (sorted_ltp[k][0] + txt_height, a[index][1])
                        text_positions[index] = sorted_ltp[k][0] + txt_height
                        break
    return text_positions

def text_plotter(text, x_data, y_data, text_positions, txt_width,txt_height):
    for z,x,y,t in zip(text, x_data, y_data, text_positions):
        plt.annotate(str(z), xy=(x-txt_width/2, t), size=12)
        if y != t:
            plt.arrow(x, t,0,y-t, color='red',alpha=0.3, width=txt_width*0.1, 
                head_width=txt_width, head_length=txt_height*0.5, 
                zorder=0,length_includes_head=True)

# start new plot
plt.clf()
plt.xlabel("Proportional Euclidean Distance")
plt.ylabel("Percentage Timewindows Attended")
plt.title("Test plot")

together = [(0, 1.0, 0.4), (25, 1.0127692669427917, 0.41), (50, 1.016404709797609, 0.41), (75, 1.1043426359673716, 0.42), (100, 1.1610446924342996, 0.44), (125, 1.1685687930691457, 0.43), (150, 1.3486407784550272, 0.45), (250, 1.4013999168008104, 0.45)]
together.sort()

text = [x for (x,y,z) in together]
eucs = [y for (x,y,z) in together]
covers = [z for (x,y,z) in together]

p1 = plt.plot(eucs,covers,color="black", alpha=0.5)

txt_height = 0.0037*(plt.ylim()[1] - plt.ylim()[0])
txt_width = 0.018*(plt.xlim()[1] - plt.xlim()[0])

text_positions = get_text_positions(text, eucs, covers, txt_width, txt_height)

text_plotter(text, eucs, covers, text_positions, txt_width, txt_height)

plt.savefig("test.png")
plt.show()

создает http://i.stack.imgur.com/xiTeU.png enter image description here

теперь более сложный график http://i.stack.imgur.com/KJeYW.png, еще немного сомнительным, но гораздо лучше! enter image description here

3