Нарисуйте квадратичный сплайн через точки в решетке
на основе этого большого вопроса:как нарисовать гладкую кривую, проходящую через точки
как это сделать в решетке?
plot(rnorm(120), rnorm(120), col="darkblue", pch=16, xlim=c(-3,3), ylim=c(-4,4))
points(rnorm(120,-1,1), rnorm(120,2,1), col="darkred", pch=16)
points(c(-1,-1.5,-3), c(4,2,0), pch=3, cex=3)
xspline(c(-1,-1.5,-3), c(4,2,0), shape = -1)
вот аналогичные данные, отформатированные более уместно для lattice
сюжет:
dat <- data.frame(x=c(rnorm(120), rnorm(120,-1,1)),
y=c(rnorm(120), rnorm(120,2,1)),
l=factor(rep(c('B','R'),each=120))
)
spl <- data.frame(x=c(-1,-1.5,-3),
y=c(4,2,0)
)
и вот что дал связанный вопрос, переведенный на lattice
:
xyplot(y ~ x,
data=dat,
groups=l,
col=c("darkblue", "darkred"),
pch=16,
panel = function(x, y, ...) {
panel.xyplot(x=spl$x, y=spl$y, pch=3, cex=3)
## panel.spline(x=spl$x, y=spl$y) ## Gives an error, need at least four 'x' values
panel.superpose(x, y, ...,
panel.groups = function(x, y, ...) {
panel.xyplot(x, y, ...)
}
)
},
xlim=c(-3,3), ylim=c(-4,4)
)
5 ответов
вот строка-для строки "перевод"базовый графическое решение в решетки.
(Непосредственность перевода становится возможной благодаря
+
оператора, предоставленные latticeExtra пакета. См.?layer
для деталей его использования.)
последняя строка вызывает grid.xspline()
, точное решетки аналог базовый графические функции xspline()
.
library(lattice)
library(grid)
library(latticeExtra)
xyplot(rnorm(120)~rnorm(120), pch=16, col="darkblue",
xlim = c(-3.1, 3.1), ylim = c(-4.1, 4.1)) +
xyplot(rnorm(120,2,1) ~ rnorm(120,-1,1), pch=16, col="darkred") +
xyplot(c(4,2,0) ~ c(-1,-1.5,-3), pch=3, cex=3) +
layer(grid.xspline(c(-1,-1.5,-3), c(4,2,0), shape = -1, default.units="native"))
(одна странная деталь решетки появляется в последней строке выше: как и несколько других его низкоуровневых функций рисования линий,grid.xspline()
по умолчанию "npc"
единицы вместо обычно-желаемых "native"
единицы, используемые по умолчанию grid.points()
и многие другие grid.*()
функции. Очевидно, что это достаточно легко изменить - - - как только вы осознаете это!)
Это немного сложно, но работает.
plot(rnorm(120), rnorm(120), col="darkblue", pch=16, xlim=c(-3,3), ylim=c(-4,4))
points(rnorm(120,-1,1), rnorm(120,2,1), col="darkred", pch=16)
points(c(-1,-1.5,-3), c(4,2,0), pch=3, cex=3)
я использую xspline
не производя ничью
dd <- xspline(c(-1,-1.5,-3), c(4,2,0), shape = -1,draw=FALSE)
тогда я использую очки, полученные witn panel.lines
library(lattice)
xyplot(y ~ x,
data=dat,
groups=l,
col=c("darkblue", "darkred"),
pch=16,
panel = function(x, y, ...) {
panel.xyplot(x=spl$x, y=spl$y, pch=3, cex=3)
panel.lines(dd$x,dd$y)
panel.superpose(x, y, ...,
panel.groups = function(x, y, ...) {
panel.xyplot(x, y, ...)
}
)
},
xlim=c(-3,3), ylim=c(-4,4)
)
это не решение, путем попытки использовать решение Josh с grid.xspline
на ggplot2
. Я думаю, что интересно получить параллель между ggplot2 / lattice.
## prepare the data
dat <- data.frame(x=c(rnorm(120), rnorm(120,-1,1)),
y=c(rnorm(120), rnorm(120,2,1)),
l=factor(rep(c('B','R'),each=120))
)
spl <- data.frame(x=c(-2,-1.5,-3),
y=c(4,2,0)
)
## prepare the scatter plot
library(ggplot(2))
p <- ggplot(data=dat,aes(x=x,y=y,color=l))+
geom_point()+
geom_point(data=spl,aes(x=x,y=y),color='darkred',size=5)
library(grid)
ff <- ggplot_build(p)
моя идея заключается в использовании масштабов, генерируемых ggplot2, для создания сплайна в той же панели, что и scatterplot. Лично я нахожу это сложным, и я надеюсь, что кто-то придет с лучшим решением.
xsp.grob <- xsplineGrob(spl$x, spl$y,
vp=viewport(xscale =ff$panel$ranges[[1]]$x.range,
yscale = ff$panel$ranges[[1]]$y.range),
shape = -1, default.units="native")
p
grid.add(gPath='panel.3-4-3-4',child=xsp.grob)
я, наконец, нашел решение этого, основываясь на ответе на этот вопрос:квадратичный сплайн
используя пакет splines
заменить panel.splines(
...)
(комментарий выше) с этим кодом:
local({
model <- lm(y ~ bs(x, degree=2), data=spl)
x0 <- seq(min(spl$x), max(spl$x), by=.1)
panel.lines(x0, predict(model, data.frame(x=x0)))
})
из превосходного предложения Джоша О'Брайена,grid.xspline()
может заменить прокомментированный-out panel.splines(
...)
линия, приводящая к точному графику, как в базовом вопросе, связанном выше (за исключением поля):
grid.xspline(spl$x, spl$y, shape = -1, default.units="native")
вот вариант панели сплайнов от Deepayan Sarkar
panel.smooth.spline <- function(x, y,
w=NULL, df, spar = NULL, cv = FALSE,
lwd=plot.line$lwd, lty=plot.line$lty,col,
col.line=plot.line$col,type, ... )
{
x <- as.numeric(x)
y <- as.numeric(y)
ok <- is.finite(x) & is.finite(y)
if (sum(ok) < 1)
return()
if (!missing(col)) {
if (missing(col.line))
col.line <- col
}
plot.line <- trellis.par.get("plot.line")
spline <- smooth.spline(x[ok], y[ok],
w=w, df=df, spar = spar, cv = cv)
pred = predict(spline,x= seq(min(x),max(x),length.out=150))
panel.lines(x = pred$x, y = pred$y, col = col.line,
lty = lty, lwd = lwd, ...)
panel.abline(h=y[which.min(x)],col=col.line,lty=2)
}