python Dask DataFrame, поддержка (тривиально распараллеливаемой) строки применяется?
Я недавно нашел ДАСК модуль, который стремится быть простой в использовании модуль параллельной обработки python. Большой пункт продажи для меня заключается в том, что он работает с пандами.
после прочтения немного на ее Man-странице, Я не могу найти способ сделать это тривиально распараллеливаемых задач:
ts.apply(func) # for pandas series
df.apply(func, axis = 1) # for pandas DF row apply
на данный момент, чтобы достичь этого в даске, АФАИК,
ddf.assign(A=lambda df: df.apply(func, axis=1)).compute() # dask DataFrame
который является уродливым синтаксисом и на самом деле медленнее, чем outright
df.apply(func, axis = 1) # for pandas DF row apply
любой предложение?
Edit: спасибо @MRocklin за функцию карты. Кажется, это медленнее, чем обычные панды. Связано ли это с проблемой выпуска pandas GIL или я делаю это неправильно?
import dask.dataframe as dd
s = pd.Series([10000]*120)
ds = dd.from_pandas(s, npartitions = 3)
def slow_func(k):
A = np.random.normal(size = k) # k = 10000
s = 0
for a in A:
if a > 0:
s += 1
else:
s -= 1
return s
s.apply(slow_func) # 0.43 sec
ds.map(slow_func).compute() # 2.04 sec
2 ответов
а в dask.dataframe
.применить ответственность делегатов к map_partitions
:
@insert_meta_param_description(pad=12)
def apply(self, func, convert_dtype=True, meta=no_default, args=(), **kwds):
""" Parallel version of pandas.Series.apply
...
"""
if meta is no_default:
msg = ("`meta` is not specified, inferred from partial data. "
"Please provide `meta` if the result is unexpected.\n"
" Before: .apply(func)\n"
" After: .apply(func, meta={'x': 'f8', 'y': 'f8'}) for dataframe result\n"
" or: .apply(func, meta=('x', 'f8')) for series result")
warnings.warn(msg)
meta = _emulate(M.apply, self._meta_nonempty, func,
convert_dtype=convert_dtype,
args=args, **kwds)
return map_partitions(M.apply, self, func,
convert_dtype, args, meta=meta, **kwds)