Создание массива numpy со всеми комбинациями чисел, сумма которых меньше заданного числа
существует несколько элегантных примеров использования numpy в Python для генерации массивов всех комбинаций. Например, ответ здесь: использование numpy для создания массива из всех комбинаций двух массивов .
теперь предположим, что есть дополнительное ограничение, а именно, сумма всех чисел не превышает заданной постоянной K
. Использование генератора и itertools.product
, например с K=3
где мы хотим комбинации трех переменных с диапазонами 0-1,0-3, 0-2 и мы можем сделать это следующим образом:
from itertools import product
K = 3
maxRange = np.array([1,3,2])
states = np.array([i for i in product(*(range(i+1) for i in maxRange)) if sum(i)<=K])
возвращает
array([[0, 0, 0],
[0, 0, 1],
[0, 0, 2],
[0, 1, 0],
[0, 1, 1],
[0, 1, 2],
[0, 2, 0],
[0, 2, 1],
[0, 3, 0],
[1, 0, 0],
[1, 0, 1],
[1, 0, 2],
[1, 1, 0],
[1, 1, 1],
[1, 2, 0]])
в принципе, подход от https://stackoverflow.com/a/25655090/1479342 может использоваться для генерации всех возможных комбинаций без ограничения, а затем выбора подмножества комбинаций, сумма которых меньше K
. Однако этот подход генерирует гораздо больше комбинаций, чем необходимо, особенно если K
относительно невелика по сравнению с sum(maxRange)
.
там должен быть способ сделать это быстрее и с меньшим использованием памяти. Как это можно достичь с помощью векторизованного подхода (например, используя np.indices
)?
2 ответов
редактировать
-
для полноты, я добавляю здесь код OP:
def partition0(max_range, S): K = len(max_range) return np.array([i for i in itertools.product(*(range(i+1) for i in max_range)) if sum(i)<=S])
-
первый подход чистый
np.indices
. Это быстро для небольшого ввода, но потребляет много памяти (OP уже указал, что это не то, что он имел в виду).def partition1(max_range, S): max_range = np.asarray(max_range, dtype = int) a = np.indices(max_range + 1) b = a.sum(axis = 0) <= S return (a[:,b].T)
-
рекуррентный подход кажется намного лучше, чем те, что указаны выше:
def partition2(max_range, max_sum): max_range = np.asarray(max_range, dtype = int).ravel() if(max_range.size == 1): return np.arange(min(max_range[0],max_sum) + 1, dtype = int).reshape(-1,1) P = partition2(max_range[1:], max_sum) # S[i] is the largest summand we can place in front of P[i] S = np.minimum(max_sum - P.sum(axis = 1), max_range[0]) offset, sz = 0, S.size out = np.empty(shape = (sz + S.sum(), P.shape[1]+1), dtype = int) out[:sz,0] = 0 out[:sz,1:] = P for i in range(1, max_range[0]+1): ind, = np.nonzero(S) offset, sz = offset + sz, ind.size out[offset:offset+sz, 0] = i out[offset:offset+sz, 1:] = P[ind] S[ind] -= 1 return out
-
после короткой мысли, я был в состоянии пройти немного дальше. Если мы заранее знаем количество возможных разделов, мы можем выделить достаточно памяти сразу. (Это несколько похоже на
cartesian
на уже связанный поток.)во-первых, нам нужна функция, которая подсчитывает перегородок.
def number_of_partitions(max_range, max_sum): ''' Returns an array arr of the same shape as max_range, where arr[j] = number of admissible partitions for j summands bounded by max_range[j:] and with sum <= max_sum ''' M = max_sum + 1 N = len(max_range) arr = np.zeros(shape=(M,N), dtype = int) arr[:,-1] = np.where(np.arange(M) <= min(max_range[-1], max_sum), 1, 0) for i in range(N-2,-1,-1): for j in range(max_range[i]+1): arr[j:,i] += arr[:M-j,i+1] return arr.sum(axis = 0)
основная функция:
def partition3(max_range, max_sum, out = None, n_part = None): if out is None: max_range = np.asarray(max_range, dtype = int).ravel() n_part = number_of_partitions(max_range, max_sum) out = np.zeros(shape = (n_part[0], max_range.size), dtype = int) if(max_range.size == 1): out[:] = np.arange(min(max_range[0],max_sum) + 1, dtype = int).reshape(-1,1) return out P = partition3(max_range[1:], max_sum, out=out[:n_part[1],1:], n_part = n_part[1:]) # P is now a useful reference S = np.minimum(max_sum - P.sum(axis = 1), max_range[0]) offset, sz = 0, S.size out[:sz,0] = 0 for i in range(1, max_range[0]+1): ind, = np.nonzero(S) offset, sz = offset + sz, ind.size out[offset:offset+sz, 0] = i out[offset:offset+sz, 1:] = P[ind] S[ind] -= 1 return out
-
некоторые тесты:
max_range = [3, 4, 6, 3, 4, 6, 3, 4, 6] for f in [partition0, partition1, partition2, partition3]: print(f.__name__ + ':') for max_sum in [5, 15, 25]: print('Sum %2d: ' % max_sum, end = '') %timeit f(max_range, max_sum) print() partition0: Sum 5: 1 loops, best of 3: 859 ms per loop Sum 15: 1 loops, best of 3: 1.39 s per loop Sum 25: 1 loops, best of 3: 3.18 s per loop partition1: Sum 5: 10 loops, best of 3: 176 ms per loop Sum 15: 1 loops, best of 3: 224 ms per loop Sum 25: 1 loops, best of 3: 403 ms per loop partition2: Sum 5: 1000 loops, best of 3: 809 µs per loop Sum 15: 10 loops, best of 3: 62.5 ms per loop Sum 25: 1 loops, best of 3: 262 ms per loop partition3: Sum 5: 1000 loops, best of 3: 853 µs per loop Sum 15: 10 loops, best of 3: 59.1 ms per loop Sum 25: 1 loops, best of 3: 249 ms per loop
и что-то большее:
%timeit partition0([3,6] * 5, 20) 1 loops, best of 3: 11.9 s per loop %timeit partition1([3,6] * 5, 20) The slowest run took 12.68 times longer than the fastest. This could mean that an intermediate result is being cached 1 loops, best of 3: 2.33 s per loop # MemoryError in another test %timeit partition2([3,6] * 5, 20) 1 loops, best of 3: 877 ms per loop %timeit partition3([3,6] * 5, 20) 1 loops, best of 3: 739 ms per loop
я не знаю, что такое numpy
подход, но вот достаточно чистое решение. Пусть A
быть массив целых чисел, и пусть k
быть числом, которое вам дано в качестве входных данных.
начните с пустого массива B
; сохранить сумму массива B
в переменной s
(изначально установлен в ноль). Примените следующую процедуру:
-
если в сумме
s
массиваB
меньшеk
, затем (i) добавьте его в коллекцию (ii) и для каждого элемента из исходного массиваA
добавить, что элементB
и обновленияs
, (iii) удалить его изA
и (iv) рекурсивно применить процедуру; (iv) когда вызов возвращается, добавьте элемент обратно вA
и обновленияs
; else ничего не делать.
этот подход снизу вверх обрезает недопустимые ветви на раннем этапе и посещает только необходимые подмножества (т. е. почти только подмножества, которые суммируются до чем k
).