установка Mayavi с модулем pip-no с именем vtk

Question

установка Mayavi с модулем pip-no с именем vtk

Я хочу использовать Mayavi.

ситуация

я использую MacBook Air с OSX 10.7.3.
я использую Python 2.7.2
я virtualenv установлен. Но я не использовал его для этой установки.

я вручную установил все зависимости, включая VTK.

на VTK, я следовал его руководству по установке и установил оболочку python.

теперь, если я открою новый окно терминала и открыть python, я могу импортировать vtk без каких-либо ошибок.

Я пытаюсь установить Mayavi со следующей командой:

pip install mayavi

но возникает следующая ошибка:

Downloading/unpacking mayavi
  Running setup.py egg_info for package mayavi
    build_src
    building extension "tvtk.array_ext" sources
    building data_files sources
    build_src: building npy-pkg config files

    no previously-included directories found matching 'artwork'
    no previously-included directories found matching 'docs/pdf'
Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): apptools in /Library/Python/2.7/site-packages (from mayavi)
Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): traits in /Library/Python/2.7/site-packages (from mayavi)
Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): traitsui in /Library/Python/2.7/site-packages (from mayavi)
Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): configobj in /Library/Python/2.7/site-packages (from apptools->mayavi)
Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): pyface in /Library/Python/2.7/site-packages (from traitsui->mayavi)
Installing collected packages: mayavi
  Running setup.py install for mayavi
    Traceback (most recent call last):
      File "<string>", line 1, in <module>
      File "/Users/Yasser/build/mayavi/setup.py", line 498, in <module>
        **config
      File "/Library/Python/2.7/site-packages/numpy-1.6.1-py2.7-macosx-10.7-intel.egg/numpy/distutils/core.py", line 186, in setup
        return old_setup(**new_attr)
      File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/core.py", line 152, in setup
        dist.run_commands()
      File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/dist.py", line 953, in run_commands
        self.run_command(cmd)
      File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/dist.py", line 972, in run_command
        cmd_obj.run()
      File "/Library/Python/2.7/site-packages/numpy-1.6.1-py2.7-macosx-10.7-intel.egg/numpy/distutils/command/install.py", line 57, in run
        r = self.setuptools_run()
      File "/Library/Python/2.7/site-packages/numpy-1.6.1-py2.7-macosx-10.7-intel.egg/numpy/distutils/command/install.py", line 31, in setuptools_run
        return old_install_mod._install.run(self)
      File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/command/install.py", line 573, in run
        self.run_command('build')
      File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/cmd.py", line 326, in run_command
        self.distribution.run_command(command)
      File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/dist.py", line 972, in run_command
        cmd_obj.run()
      File "/Users/Yasser/build/mayavi/setup.py", line 303, in run
        build_tvtk_classes_zip()
      File "/Users/Yasser/build/mayavi/setup.py", line 290, in build_tvtk_classes_zip
        gen_tvtk_classes_zip()
      File "tvtk/setup.py", line 46, in gen_tvtk_classes_zip
        from code_gen import TVTKGenerator
      File "tvtk/code_gen.py", line 10, in <module>
        import vtk
    ImportError: No module named vtk
    Complete output from command /usr/bin/python -c "import setuptools;__file__='/Users/Yasser/build/mayavi/setup.py';exec(compile(open(__file__).read().replace('rn', 'n'), __file__, 'exec'))" install --single-version-externally-managed --record /var/folders/53/_trhc_0x0fb6kvx6bw_wrk500000gn/T/pip-Z4hpsW-record/install-record.txt:
    running install

running build

Traceback (most recent call last):

  File "<string>", line 1, in <module>

  File "/Users/Yasser/build/mayavi/setup.py", line 498, in <module>

    **config

  File "/Library/Python/2.7/site-packages/numpy-1.6.1-py2.7-macosx-10.7-intel.egg/numpy/distutils/core.py", line 186, in setup

    return old_setup(**new_attr)

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/core.py", line 152, in setup

    dist.run_commands()

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/dist.py", line 953, in run_commands

    self.run_command(cmd)

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/dist.py", line 972, in run_command

    cmd_obj.run()

  File "/Library/Python/2.7/site-packages/numpy-1.6.1-py2.7-macosx-10.7-intel.egg/numpy/distutils/command/install.py", line 57, in run

    r = self.setuptools_run()

  File "/Library/Python/2.7/site-packages/numpy-1.6.1-py2.7-macosx-10.7-intel.egg/numpy/distutils/command/install.py", line 31, in setuptools_run

    return old_install_mod._install.run(self)

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/command/install.py", line 573, in run

    self.run_command('build')

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/cmd.py", line 326, in run_command

    self.distribution.run_command(command)

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/dist.py", line 972, in run_command

    cmd_obj.run()

  File "/Users/Yasser/build/mayavi/setup.py", line 303, in run

    build_tvtk_classes_zip()

  File "/Users/Yasser/build/mayavi/setup.py", line 290, in build_tvtk_classes_zip

    gen_tvtk_classes_zip()

  File "tvtk/setup.py", line 46, in gen_tvtk_classes_zip

    from code_gen import TVTKGenerator

  File "tvtk/code_gen.py", line 10, in <module>

    import vtk

ImportError: No module named vtk

----------------------------------------
Command /usr/bin/python -c "import setuptools;__file__='/Users/Yasser/build/mayavi/setup.py';exec(compile(open(__file__).read().replace('rn', 'n'), __file__, 'exec'))" install --single-version-externally-managed --record /var/folders/53/_trhc_0x0fb6kvx6bw_wrk500000gn/T/pip-Z4hpsW-record/install-record.txt failed with error code 1 in /Users/Yasser/build/mayavi
Storing complete log in /Users/Yasser/Library/Logs/pip.log
Traceback (most recent call last):
  File "/usr/local/bin/pip", line 8, in <module>
    load_entry_point('pip==1.1', 'console_scripts', 'pip')()
  File "/Library/Python/2.7/site-packages/pip-1.1-py2.7.egg/pip/__init__.py", line 116, in main
    return command.main(args[1:], options)
  File "/Library/Python/2.7/site-packages/pip-1.1-py2.7.egg/pip/basecommand.py", line 141, in main
    log_fp = open_logfile(log_fn, 'w')
  File "/Library/Python/2.7/site-packages/pip-1.1-py2.7.egg/pip/basecommand.py", line 168, in open_logfile
    log_fp = open(filename, mode)
IOError: [Errno 13] Permission denied: '/Users/Yasser/Library/Logs/pip.log'

Я думаю, что проблема с vtk.

может кто-нибудь помочь мне?

Другие Подробности

под управлением sudo pip install mayavi не решает проблему.

Я думал, что это может помогите!--11-->

› which python
/usr/local/bin/python

› python
Python 2.7.2 (default, Feb 17 2012, 13:57:55) 
[GCC 4.2.1 (Based on Apple Inc. build 5658) (LLVM build 2335.15.00)] on darwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import vtk
>>> vtk
<module 'vtk' from '/usr/local/Cellar/python/2.7.2/lib/python2.7/site-packages/VTK-5.10.0-py2.7.egg/vtk/__init__.pyc'>
>>>

мой PYTHONPATH пусто.

28

installation mayavi pip python vtk

автор: Zero Piraeus

6 ответов

автор: Hugo Tavares · Accepted Answer · 2012-08-30 23:09:38

код pip вероятно, использует другой python, вид у вас vtk установить с помощью /usr/local/bin/python, а pip бинарные использует /usr/bin/python.

проверить это:

$ head -n1 $(which pip)

чтобы получить его решение, вы можете использовать virtualenv установка pip используя /usr/local/bin/python:

curl https://raw.github.com/pypa/pip/master/contrib/get-pip.py | /usr/local/bin/python

дополнительные инструкции по установке см. В разделе http://www.pip-installer.org/en/latest/installing.html

автор: Hennadii Madan · Accepted Answer · 2017-02-14 16:30:49

Я на Debian, но это должно работать и для вас

Я застрял с установкой vtk в virtualenv, после нескольких часов поиска без результатов я сделал следующее, И это сработало.

установить python-vtk из репозиториев по всей системе
папку ВТК скопировать из /usr/lib в/pymodules/вместо python2.7 в /путь/к/вашему/виртуальное окружение/Либ/вместо python2.7/сайт-пакеты

в вашем случае общесистемный python папка packages, вероятно, будет отличаться, но вы можете легко найти ее, запустив system python и введя следующее:

import vtk,sys
print(sys.modules['vtk'])

после этого трюка mayavi был успешно установлен в мой virtualenv с помощью pip install mayavi и pip install envisage.

Edit: вместо копирования может быть лучше просто символически связать папку на Шаге 2

автор: Alex · Accepted Answer · 2014-05-18 00:08:17

У меня была та же проблема, и первый ответ не помог мне, потому что pip был в правильном каталоге, но оказалось, что у меня не было установленного vtk - запуск sudo apt-get install python-vtk исправил проблему, и я смог успешно запустить pip install mayavi после этого.

автор: PytLab · Accepted Answer · 2016-10-28 08:45:32

у меня была такая же проблема при установке mayavi с python, установленным в pyenv, и я решил эту проблему, скопировав каталог в /home/myname/.pyenv/versions/2.7.12/lib/python2.7/site-packages ниже есть мой метод:

установить vtk и python-vtk

sudo apt-get install vtk6
sudo apt-get install python-vtk

попробовать python -c "import vtk", если снова не удалось, перейдите к шагу 3
ошибка импорта может быть вызвана потерей папки пакета vtk в текущем python, поэтому мы должны найти папку vtk и скопировать в ваш текущий python (наиболее возможный python в каталоге pyenv shims).

путь к папке vtk в моем ubuntu -
```
/usr/lib/python2.7/dist-packages/vtk
```
просто скопировать vtk папка для вашего текущего python в /site-packages, например,
```
cp -r /usr/lib/python2.7/dist-packages/vtk /home/myname/pyenv/versions/2.7.12/lib/python2.7/site-packages
```
попробовать python -c "import vtk" снова.
если нет ошибки импорта, просто сделайте
```
pip install mayavi
```

автор: Paul Chen · Accepted Answer · 2018-06-25 20:59:34

Я настоял на sudo установить несколько раз, наконец, решил, не знаю, как объяснить.

sudo python2 -m pip install mayavi

sudo python3 -m pip install mayavi

автор: Tomas · Accepted Answer · 2017-02-14 16:25:49

Я установил vtk с помощью Homebrew:

$ brew install vtk

надеюсь, что это помогает.